Стоит начать с того, что боль в мышцах бывает трёх видов.
Первая - возникает в момент выполнения упражнения и обычно бывает резкой и сильной. Конечно, терпеть такую боль в мышцах нельзя. Необходимо немедленно прекратить выполнение подхода, постараться выяснить причину и в случае необходимости обратиться к врачу, т.к это может свидетельствовать о полученной травме.
Второй вид мышечной боли - проявляется на следующий день после тренировки. У меня обычно сильная крепатура мышц (болевые ощущения) ощущается ближе к обеду/вечеру на следующий день. Особенность этого вида в том, что через пару дней боль пройдёт, а Ваш организм станет более вынослив и адаптирован к бОльшей нагрузке.
Отвечая на вопрос можно ли тренироваться при наличии сильной крепатуры в мышцах, лучше спросить «А нужно ли это делать?». Мышца и так была повреждена днём/двумя днями ранее, скорее всего сейчас она воспалена и снова нагрузив её сполна, положительного эффекта мы точно не получим. Поэтому организму лучше дать отдых.