Это редкий, но довольно спорный вопрос, с которым периодически сталкиваются предприниматели. И здесь действуют исключения из законодательства о которых очень часто не знают и потом начинают разбираться, когда приходят требования об уплате налогов и штрафы за не сданную отчетность. Если вы ИП и вам доверили недвижимое имущество по Договору доверительного управления, то вы обязаны платить НДС независимо от того УСН или ОСНО у вас.
Так как операции доверительного управляющего признаются объектом налогообложения НДС в соответствии с законодательством (ст. 146 НК РФ).
То есть НДС, уплачиваемый в соответствии со статьей 174.1 НК РФ является исключением из общего порядка “упрощенки” (пункт 2 статьи 346.11 главы 26.2 «Упрощенная система налогообложения» НК РФ).
Таким образом, вы обязаны выставлять счет-фактуры своим клиентам с указанием НДС.
К сожалению, и с патентом все не так радужно. Согласно законодательству к имуществу по Договору доверительного управления не может быть применен патент.
Поэтому, на мой взгляд, лучше избегать подобных договоров в вашей предпринимательской деятельности.