Помимо самой игры, источником информации послужил официальный артбук (ссылка на него в русском переводе ЗДЕСЬ).
Действие происходит в умирающем мире. Некий гуманоидный персонаж ползёт по направлению к башне, но проваливается в расщелину и оказывается внутри перерабатывающей фабрики.
Переработке подвергались формовщики - искусственно выведенная раса с крайне примитивным интеллектом и неразвитым телом. Их содержали в ужасных условиях, ещё живых подвергали пакованию, убивали чудовищными орудиями и использовали их переработанные тела, в том числе, в качестве стройматериала. Ныне фабрика заброшена, мёртвые тела формовщиков свалены в кучи.
Технологии в этом мире представляют собой сочетание органики и механики. Они приводятся в действие сердечными мышцами, нервными окончаниями, органическими трубками. Для взаимодействия с большинством из них приходится просовывать руки в нечто вроде биологических отверстий.
Сама фабрика работает от огромного сердца, которое ныне пребывает в не лучшем состоянии.
Открыв проход, герой попадает в помещения со странными большими наростами.
В центре комнаты расположено нечто вроде биореактора.
Чтобы открыть путь на поверхность, герой закачивает в реактор некую белую жидкость, а затем пытается его запустить.
В ходе запуска происходит авария: вязкая жидкость выливается наружу и заливает всё помещение, включая самого героя.
Спустя неизвестное количество времени герой, претерпевший мутации от воздействия жидкости, пробуждается.
Комната претерпела некоторые изменения: наросты стали ещё больше и уродливее, весь пол покрыт слоем органической ткани.
В это время второй герой пробуждается из кокона внутри Стены. Стена представляет собой гигантскую искусственную матку, которая выращивает гуманоидных особей. Когда особь полностью сформирована, её спина начинает давить на стенку кокона, и она вываливается к подножию Стены. Выживание особи сразу после рождения напрямую зависит от высоты, на которой располагался её кокон: если он был слишком высоко, новорождённый разбивается при падении, о чём свидетельствуют останки других гуманоидов у подножия.
Вывалившись из кокона, второй герой оказывается в неприветливой пустоши, где нет никакого намёка на жизнь, кроме заполняющих всё вокруг щупалец загадочной биомассы.
Также тут и там обнаруживаются останки подобных герою гуманоидов, видимо пытавшихся преодолеть тот же путь, что и он, но потерпевших неудачу.
Герой попадает в другую часть фабрики, где находится лаборатория по выращиванию гуманоидов, принадлежащих к местной высшей расе (к которой сам герой не относится). В отличие от существ, рождаемых Стеной, эти гуманоиды выращиваются в безопасности, после пробуждения каждый из них получает ключ для отпирания замков и медицинский инструмент.
Пока герой бродит по коридорам, за ним следит проворное существо с повадками ящерицы. Улучив момент, оно нападает на героя и прирастает к его спине, запуская руки в его брюшную полость.
Однако, от нежелательного попутчика есть польза: герой получает приросший к хвосту паразита ключ, с помощью которого можно открывать проходы и пользоваться местным оружием (также органическим в своей основе).
С помощью системы подъёмников герой спускается вглубь Кратера, где всё заполнено растущей биомассой, из которой рождаются уродливые, недоразвитые существа с агрессивным поведением.
Рождением всё новых и новых существ занимается королева Кратера - гигантская, но беспомощная биомасса, телеса которой обволакивают центральный лифт.
Чтобы пройти дальше, герою приходится пробить тело королевы в нескольких местах. Затем он запускает лифт и поднимается на поверхность вместе с королевой, которую разрывает. Однако она всё ещё жива и беспомощно взирает на своё изувеченное тело.
Пользуясь транспортной системой, герой отправляется в находящийся на отдельном острове Полис, состоящий из нескольких цитаделей - обитель местной высшей расы. Здесь нет никакой растущей биомассы и агрессивных существ - в величественном Полисе царит запустение. Причём довольно давно, судя по эрозии зданий.
Полис богат статуями и барельефами, которые проливают немного света на историю высшей расы. Гуманоиды считали свои смертные тела несовершенными и искали способы освободить своё сознание, чтобы достигнуть вознесения и обрести бессмертие. Вознесённое сознание они представляли в виде прото-существа, напоминающего крылатого осьминога. Они исследовали дихотомию жизни и смерти, экспериментировали с влиянием боли на разум, считали сексуальное удовлетворение высшим уровнем сознания, достижимым в несовершенных телах. В какой-то момент гуманоиды утратили способность к живорождению и были вынуждены искусственно выращивать новых особей.
В центральном зале храма располагаются распятые гуманоиды, соединённые с единой нервной системой под потолком.
Герою нужно активировать управляемые оболочки, для чего необходима жидкость, добываемая из активных гомункулов.
Гомункулы - ещё одна искусственно выведенная раса, использовавшаяся в качестве живых батареек. Однако, помимо этого, гомункулы обладали высоким интеллектом и выдающимися инженерными навыками. Ненавидя высшую расу, они создали из мёртвых тел гуманоидов управляемых киборгов и атаковали Полис, что привело к кровопролитной войне, предположительно ознаменовавшей закат этой цивилизации.
Всё время совместного путешествия паразит прорастал в тело героя, пока этот процесс не дошёл до того, что тот лишился возможности нормально пользоваться руками (а это важно, поскольку руки нужны для взаимодействия с замками).
Герой решает избавится от паразита. Предчувствуя это, паразит начинает прорастать активнее и разрывает герою живот.
Однако он успевает запустить манипулятор. Становится окончательно ясно, что паразит - это первый герой, мутировавший под воздействием заражённой жидкости из биореактора.
Отцепленный от второго героя, паразит скрывается.
Второй герой с разорванным животом еле добирается до центрального зала, где робот-хирург проводит необходимые манипуляции, подключая его сознание к единой сети.
Получив управление двумя оболочками, герой с их помощью выносит собственное тело через ворота наружу, к таинственному порталу.
У самого подножия портала на него вновь нападает паразит.
В этот раз они уже окончательно срастаются, превращаясь в неподвижную биомассу, пустившую корни у подножия портала.
На этом игра заканчивается.
Моя трактовка сюжета: