Кто они, загадочные обитатели человеческого тела?
Учёные из Стэнфордского университета обнаружили в человеческом пищеварительном тракте новый класс жизни, который они назвали "Обелисками". Эта находка, ещё не прошедшая рецензирование, опубликована на bioRxiv.
Исследователи, возглавляемые биологом Иваном Желудевым, проанализировали 5,4 миллиона генетических последовательностей и выявили почти 30 000 различных "Обелисков". Эти элементы обнаружены примерно в 10% исследованных микробиомов человека, причём в 50% образцов из полости рта они встречались у пациентов, что свидетельствует о том, что "Обелиски" могут быть обнаружены в различных частях тела.
"Обелиски" представляют собой РНК размером около 1000 нуклеотидов, и их уникальная структура, напоминающая симметричные стержневидные объекты, могла быть причиной того, что они долго оставались незамеченными. Эти РНК не имеют схожести с известными биологическими агентами, что может указывать на их принадлежность к новой группе сущностей, возможно, связанной с переходом от простейших молекул к более сложным вирусам.
Исследователи выделили один тип "Обелиска" из микробов, таких как бактерия Streptococcus sanguinis, обитающая в человеческом рту. Один из обнаруженных "Обелисков" имел петлю из 1137 нуклеотидов.
Кроме того, "Обелиски" кодируют белки, которые учёные назвали "Облинами". Эти белки составляют значительную часть генетического материала "Обелисков" и могут быть вовлечены в их репликацию.
В отличие от известных РНК-петель (вироидов), "Обелиски" кодируют белки, но не имеют генов для создания белковых оболочек, как у РНК-вирусов (включая COVID-19). Они также крупнее плазмид, которые состоят из ДНК и присутствуют в клетках растений и бактерий.
Однако учёные пока не смогли определить, как "Обелиски" влияют на их бактериальных хозяев или как распространяются между клетками. Это привело к предположению, что эти элементы могут быть похожи на "РНК-плазмиды", а не на вирусы.
