Исток этого скромного городского водотока находился в одном километре западнее того места, где сегодня пересекаются проспект Маршала Жукова и Дорога на Турухтанные острова. Неподалеку отсюда находятся Лесной мол, нефтяной терминал, рыбный порт и другие портовые объекты.
Река впадала раньше в Невскую губу около устья Екатерингофки — в районе большого бассейна гавани Лесной, образовывая при этом два островка — Латисаари и Лаврахолм (в переводе с финского — «остров при заливе» и «остров Лавра»).
Название Емельяновка известно со второй половины того же XVIII века. Считается, что река получила свое наименование по имени или фамилии человека, владевшего участком земли в этой окраинной местности. Правда, не исключено, что раньше у нее было другое название — речка Черная, поскольку на ее берегах была деревенька Мустилахара, что в переводе с финского означает «покос на Черной».
Протекала река тогда через деревню Емельяновка, благодаря чему и получила свое название. Но в 1920 году деревню переименовали в Алексеевку — в честь погибшего революционера Василия Алексеева, одного из организаторов ленинградского комсомола, который работал на Путиловском заводе и родился в той деревушке. В 1960‑е годы реке вернули ее историческое название.
В 70‑х годах прошлого века, когда развернулось строительство, эту юго-западную речку почти на всем ее протяжении засыпали. От прежнего русла водотока остались только небольшой его участок и устье на территории Кировского завода, входящее в большой бассейн (раньше его называли Емельяновская Лахта) судостроительного завода «Северная верфь».