А вот беспокойное царствование Павла I оказалось весьма непродолжительным, и уже в 1801 году Кремль начали готовить к коронации государя императора Александра Павловича. Августейшая чата остановилась в Москве в Слободском дворце (Лефортово). Коронация состоялась в 15 апреля 1801 года. Особенностью ее стало впервые в русской истории, присутствие на церемонии вдовствующей императрицы Марии Федоровны, для которой в Успенском соборе было сооружено отдельное тронное место. Были там и младшие братья Александра - великие князья Константин Павлович (двадцати двух лет), Николай Павлович (пяти лет) и Михаил Павлович (трех лет). Согласно Акту о престолонаследии старший из них, Константин, был объявлен наследником престола (своих детей у Александра I тогда не было, он умер бездетным).
А к концу XVIII столетия дворцовые здания в Кремле пришли в крайнее запустение и обветшалость. И так как многие из них полуобвалились и грозили падением, возле них была запрещена езда. А мост у Троицких ворот стал самым разбойным местом во всей Москве. Начало XIX века отмечено большими работами по переустройству Кремля. Так как многие здание были ветхими, они были разобраны, в том числе древние - Колымажные ворота, Сретенский собор и другие. Водовзводная башня, прочность которой вызывала сомнения, в 1805 году была разобрана до фундамента. Убедившись в необоснованности опасений, уже в следующем году башню сложили вновь. На месте Троицкого подворья по проекту архитектора И.В. Еготова в 1806 году началось строительство здания, специально предназначенного для хранения сокровищ Оружейной палаты. Из-за угрозов пожара это здание построили без отопления. Строительство было завершенно в 1810 году, однако внутренняя отделка продолжалась до 1812 года.
12 июня 1812 года войска Наполеона перешли Неман и вторглись в пределы Российской империи. Началась Отечественная война. Целью французского императора было разгромить последнюю в Европе державу, способную ему противостоять. Русская армия с боями отходила, прикрывая направление на Москву.
Александр I покинул отступающую армию и и вечером 11 июля прибыл в Москву. Хоть и просил не объявлять о своем приезде, знал весь город. Когда на следующее утро Александр I вышел на Красное крыльцо, направляясь в Успенский собор, увидел огромные толпы, пришедшие его приветствовать. Крики "ура" звучали громче колокольного звона. Император поклонился народу и спустился по длинной лестнице вдоль стены Грановитой палаты. Море восторженных верноподданных подхватили его вместе со свитой и вынесли на центр Соборной площади и дальше к колокольне Ивана Великого. Кто-то из толпы кричал, что готовы за него умереть. В Успенском соборе состоялся благодарственный молебен по случаю заключения мира с Турцией.
