Видят ли работники пунктов выдачи Wildberries, что я заказал?

Конечно же видят. Иначе как клиенты смогли бы делать частичный возврат покупки?

Если заказываете то, что им видеть нежелательно - оформляйте доставку через постаматы или курьера.