Влияние микробиоты кишечника на здоровье становится все более интересной областью для исследований в последние годы. Показано, что наряду со множеством факторов, на микробиом кишечника влияет эстроген, при этом и микробиом кишечника также значительно влияет на уровень эстрогена в организме. Важный вклад микробиоты кишечника человека в физиологию хозяина вносит функциональный эстроболом - совокупность генов кишечных бактерий, продукты которых способны метаболизировать эстрогены. При этом особенно важны виды бактерий, обладающие β-глюкуронидазами и β-глюкуронидами, ферментами, участвующими в деконъюгации и конъюгации эстрогенов. Именно эти «активные» деконъюгированные и несвязанные эстрогены попадают в кровоток и впоследствии действуют на рецептор эстрогена альфа (ERα) и рецептор эстрогена бета (ERβ). Фитоэстрогены, попадающие в пищеварительный тракт, также метаболизируются таким образом, обеспечивая их способность действовать через механизмы, включающие ERα и ERβ. Эстроболом влияет на