Уважаемые коллеги, доброго времени суток! Представляем вам Biochimica et Biophysica Acta - Gene Regulatory Mechanisms - научное издание из Нидерландов, его адрес - https://www.sciencedirect.com/journal/biochimica-et-biophysica-acta-bba-gene-regulatory-mechanisms. Журнал имеет первый квартиль, издается в Elsevier, его SJR за 2019 г. равен 1.92, импакт-фактор - 3,510, печатный ISSN - 1874-9399, электронный - 1876-4320, предметные области - Структурная биология, Молекулярная биология, Биохимия, Биофизика, Генетика. Вот так выглядит обложка:
Редактором является Патрик Линдер, контактные данные - patrick.linder@unige.ch
Издание включает в себя доклады, описывающие новые идеи о механизмах транскрипционной, посттранскрипционной и трансляционной регуляции генов. Особое внимание уделяется работам, выявляющим эпигенетические механизмы регуляции генов, включая хроматин, модификацию и ремоделирование. Данный раздел также охватывает механистические исследования регуляторных белков и белковых комплексов, регуляторные или механистические аспекты обработки РНК, регуляцию экспрессии малыми РНК, геномный анализ паттернов экспрессии генов и моделирование регуляторных путей генов. Статьи, описывающие промоторы генов, энхансеры, глушители или другие регуляторные области ДНК, должны включать в себя актуальные исследования функций.
Пример статьи, название - Network-driven discovery yields new insight into Shox2-dependent cardiac rhythm control. Заголовок (Abstract) - The homeodomain transcription factor SHOX2 is involved in the development and function of the heart's primary pacemaker, the sinoatrial node (SAN), and has been associated with cardiac conduction-related diseases such as atrial fibrillation and sinus node dysfunction. To shed light on Shox2-dependent genetic processes involved in these diseases, we established a murine embryonic stem cell (ESC) cardiac differentiation model to investigate Shox2 pathways in SAN-like cardiomyocytes. Differential RNA-seq-based expression profiling of Shox2 +/+ and Shox2 −/− ESCs revealed 94 dysregulated transcripts in Shox2 −/− ESC-derived SAN-like cells. Of these, 15 putative Shox2 target genes were selected for further validation based on comparative expression analysis with SAN- and right atria-enriched genes. Network-based analyses, integrating data from the Mouse Organogenesis Cell Atlas and the Ingenuity pathways, as well as validation in mouse and zebrafish models confirmed a regulatory role for the novel identified Shox2 target genes including Cav1 , Fkbp10 , Igfbp5 , Mcf2l and Nr2f2 . Our results indicate that genetic networks involving SHOX2 may contribute to conduction traits through the regulation of these genes.