Ксения родилась 30 августа в 1582 году. Ксения была дочерью царя Бориса Годунова и Марии Григорьевны Скуратовой, внучкой Малюты Скуратова. Царская дочь получила хорошее образование, была обучена «писанию книжному» и музыке. Отличалась красотой и умом. Была среднего роста, лицом бела и румяна, с чёрными волнистыми волосами и большими чёрными глазами. Ксении было 16 лет, когда её отец стал царем. Во время его торжественного вступления в Москву 30 апреля 1598 года она шла рядом с царем Борисом. Конечно же Ксению готовили к замужеству политически выгодному русскому государству, но Борис Годунов хотел найти дочери мужа не только богатого и власть имущего, но порядочного и набожного. Мнение царевны о женихе имело большое значение. Царь Борис пытался составить дочери роскошную партию, вот несостоявшиеся женихи Ксении: принц Густав Шведский, эрцгерцог Максимилиан Эрнст Австрийский, принц Иоанн Шлезвиг-Гольштейнский. Но все попытки оказались несчастливыми в это время появился Лжедмитрий I. Бори