Найти тему
m40r / AreaDNA

Mycoplasma gallisepticum и ее промоторы

Оглавление

Рисунок 1. Электронная микрофотография Mycoplasma gallisepticum. Линейка имеет размер 140 нм.
Wikipedia
Рисунок 1. Электронная микрофотография Mycoplasma gallisepticum. Линейка имеет размер 140 нм. Wikipedia

Mycoplasma gallisepticum является значимым для, что называется, народного хозяйства вредителем птицы. Дикие виды также подвержены ей. Сам подозреваемый изображен на рисунке 1, его преступление — на рисунке 2. Развивающаяся при этом #инфекция затрагивает дыхательные пути.

Рисунок 2. Сканирующая электронная микроскопия эритроцитов овцы (а) и курицы (б) после инфекции in vitro штаммом M. gallisepticum Rlow. Стрелки показывают самих микоплазм или следы их внедрения на поверхности эритроцитов.
[11]
Рисунок 2. Сканирующая электронная микроскопия эритроцитов овцы (а) и курицы (б) после инфекции in vitro штаммом M. gallisepticum Rlow. Стрелки показывают самих микоплазм или следы их внедрения на поверхности эритроцитов. [11]

Как и положено представителю племени Mollicuta, клетка галлисептикумa очень сильно упрощена. Соответствующим образом оказался «оптимизирован» и ее геном, приобретя характерные черты такового у внутриклеточного паразита. Живя на всем готовом, эта #бактерия потеряла многие метаболические и регуляторные пути. О масштабах потерь можно судить по рисунку 3. На нем приведены схемы регуляции транскрипции для трех представителей Mollicuta. Наряду с предметом нашего обсуждения M. gallisepticum приведены также данные для паразита домашней пчелы Spiroplasma melliferum и Acholeplasma laidlawii — свободноживущей #бактерии , добывающей пропитание за счет комменсального (взаимовыгодного) симбиоза с растениями и использования разлагающегося субстрата. Схема регуляции в этой связи для последней не приведена — для этого «самостоятельного» организма она занимает впятеро больше места.

Среди немногочисленных описанных генов M. gallisepticum есть генное семейство гемагглютинина и вариабельного липопротеинаvlhA (variable lipoprotein and hemagglutinin). Повторимся: липопротеины — белки с липидной надстройкой, которые микоплазма способна активно менять. С гемагглютинином все несколько скучнее. А именно он нужен патогену для собственно посадки и взаимодействия с поверхностью хозяйской клетки. Функция vlhA-белков, однако, остается не выясненной до конца. По-видимому, они задействованы в адгезии клеток и проникновении паразита внутрь. Семейство включает немногим больше 40 генов, которые организованы в 3–5 кассет. Обращает на себя внимание, что структура промоторов таких генов существенно отличается от таковых других генов M. gallisepticum [4].

Те самые сорок

«Обычные» промоторы бактерий, управляющие активностью генов фазы активного роста культуры в, так скажем, «мирное время», имеют определенную консервативную (универсальную для них всех в определенных участках) последовательность. Такие промоторы узнает выполняющий транскрипцию фермент РНК-полимераза в комплексе с субъединицей сигма-70. Это своего рода «вставляющаяся» часть составного комплекса на основе РНК-полимеразы — так называемого холофермента. Именно такой сигма-фактор определяет специфическое взаимодействие с промоторами некоторой группы. Промоторы же генов vlhA лишены консервативной последовательности, характерной для специфично узнающихся сигма-70 промоторов. Высказаны предположения, что гены vlhA могут иметь некоторую альтернативную сигма-субъединицу. Но самое, пожалуй, любопытное в них — область тринуклеотидных повторов GAA перед самóй последовательностью генов. Такие повторы последовательности #ДНК называются короткими тандемными (short sequence repeats, SSR), или микросателлитами [6]. В отличие от не повторяющихся участков ДНК, они эволюционируют иначе — в целом более изменчивы и динамичны. SSR характерны для самых различных геномов, и в случае прокариот обнаружены в генах, кодирующих различные факторы вирулентности. Именно они и придают патогенам патогенность. К числу таких генов принадлежат и ферменты — в частности, отвечающие за модификацию липополисахаридов или адгезинов (тоже служат для того, чтобы бактерия «пришвартовалась» к клетке-хозяину). Таким образом, микросателлиты делают возможными высокую генетическую и фенотипическую изменчивость. При этом область GAA-повторов Mycoplasma gallisepticum может активно меняться — как по числу повторов, так и по нуклеотидам в них. Такие изменения возникают как следствие ошибок репликации, когда часть последовательности повторов выпетливается и дуплекс ДНК оказывается как бы проскользнувшим. Свой вклад могут вносить также нарушения процессов репарации ДНК [6].

Очень интересно, что галлисептикум единовременно экспрессирует один и только один #ген семейства vlhA. Ведь большинство факторов транскрипции и вообще соответствующей регуляции его редуцированный геном утратил. Как же M. gallispeticum удается менять различные режимы жизненного цикла (все та же phase variation) и переключать экспрессию семейства vlhA, оставив в положении «ВКЛ» всего один из них?

полный текст см. https://biomolecula.ru/articles/ali-baba-i-40-promotorov

Наука
7 млн интересуются