Синдром Ашер — это аутосомно-рецессивное расстройство, приводящее к потере слуха и прогрессирующему пигменту ретинита (ПР).
По оценкам, на него приходится 50% совокупной степени глухоты и слепоты у взрослых.
Когда оба родителя являются носителями синдрома Ашер, у ребенка есть шанс 1 к 4 (25%) наследовать две измененные копии генов.
Выявление патогенных вариантов в семьях повышенного риска полезно для генетического консультирования и репродуктивного управления. Как только будут выявлены патогенные варианты, пострадавшей паре может быть предложено пройти предимплантационное генетическое тестирование на наличие моногенных дефектов (PGT-M).
PGT-M - это метод идентификации эмбрионов, пораженных моногенными дефектами. Он дает потенциальным парам, которые являются носителями одних и тех же рецессивных моногенных расстройств, возможность избежать возникновения таких заболеваний.
PGT-M впервые был использован для предотвращения передачи пораженного мужского эмбриона с Х-сцепленными нарушениями.
Выпадение аллелей (ADO) является неотъемлемым дефектом одноклеточной полимеразной цепной реакции (ПЦР), вызванным амплификацией, представляющей большую угрозу для точности диагностики. Для решения этой проблемы были разработаны различные методы амплификации всего генома (WGA).
Амплификация множественного смещения (MDA) становится предпочтительным подходом для PGT-M в связи с низкой частотой ошибок и улучшенного охвата генома. Тем не менее, ADO все еще происходит в некоторых случаях. Было разработано несколько молекулярных стратегий для определения ADO и избежания ошибочного диагноза.
Мультиплексная ПЦР в сочетании с анализом связанных короткотандемных повторений (STR) представляет собой серьезную проблему из-за ее трудоемкой и персонализированной конструкции. Массив SNP является быстрой и универсальной альтернативой. Массив SNP позволяет проводить тестирование всей хромосомной анеуплоидии и общих структурных хромосомных аберраций. Однако высокая стоимость может стать барьером для его клинического применения.
В последние несколько лет секвенирование следующего поколения (NGS) непрерывно развивается, что приводит к снижению затрат и времени, для его проведения. В клинической практике гаплотипирование SNPs на основе NGS широко применяется к PGT-M.
Примечательно, что во всех случаях инвазивная пренатальная диагностика является оправданной, чтобы избежать ошибочной диагностики. В последнее время доказано, что низкоплотная цельногеномная NGS является чувствительным и высокоразрешающим методом обнаружения хромосомной анеуплоидии и больших дисбалансов. Он может обнаружить 25% хромосомного мозаицизма аномально. Таким образом, инвазивное обнаружение аномалий в пренатальной хромосоме на основе NGS может дать важную генетическую информацию.
Целевая последовательность захвата является мощным инструментом для разработки персонализированного PGT-M, который может быть легко распространен на другие гены. Интегрированное применение различных методов генетического обнаружения на основе NGS на разных репродуктивных стадиях может предоставить исчерпывающую информацию для генетического консультирования и принятия клинических решений.
