Большое количество охраняемых природных территорий и объектов свидетельствует о том, что Хорватия является страной с исключительной, разнообразной и относительно хорошо сохранившейся природной красотой.
Первые правовые нормы в Хорватии по защите природных ресурсов были приняты еще в 13 веке, когда обезлесение в районах Трогира, Корчула и Дубровника было ограничено. А движение за охрану природы началось в 19 веке.
Закон "Об охране природы" определяет 9 категорий пространств для охраны природы, а наиболее красивые и ценные охраняемые территории включают в себя два заповедника, восемь национальных парков и одиннадцать природных парков.
Национальные парки охватывают обширные, уникальные территории с одной или несколькими сохранившимися экосистемами. Национальный парк Плитвицких озер и Национальный парк Крка могут похвастаться уникальной морфологией и гидрологией карстовых пород с великолепными водопадами и озерами. Корнати и Млет - это островные национальные парки с уникальными ландшафтами и богатыми подводными мирами. К островам Бриони относятся культурные парки и ценное культурное и историческое наследие классической эпохи. Рисняк, Пакленица и Северный Велебит - горные районы с характерными рельефными особенностями, состоящими из известняковых скал и глубоких каньонов, с высокими лугами и обширными лесами.
Природный парк - это частично обработанная территория с важными экологическими характеристиками, на которой даже разрешена определенная хозяйственная деятельность. Из 11 природных парков Хорватии 6 находятся в горах (Велебит, Биоково, Медведница, Папук, Учка и Жумберак-Самобор). Телащица и острова Ластово - это островные парки, которые отличаются широким спектром наземного и морского биоразнообразия. Копачки рит и Лоньское поле являются низменными водно-болотными угодьями, средой обитания редких видов животных и домов с оригинальной народной архитектурой. Вранское озеро является особенно важным орнитологическим местом для гнездования и зимовки птиц.
Национальные и природные парки занимают общую площадь в 5 151 км², что составляет 9,1% территории страны. К другим категориям охраняемых природных объектов относятся специальные заповедники, региональные парки, памятники природы, лесопарки и монументальная архитектура. Вся природоохранная деятельность осуществляется под руководством Государственного института по охране природы.
Некоторые особо охраняемые природные территории включены в международную систему охраны природы. Плитвицкие озера включены в Список всемирного природного наследия, гора Велебит и региональный парк Мура-Драва-Дануб входят в международную сеть биосферных заповедников (Человек и биосфера - МАБ), а Копачки рит, Лоньское поле, дельта Неретвы, Црна-Млака и озеро Вранско (с 2013) включены в международный список ценных водно-болотных угодий (Конвенция Рамсар). Природный парк Папук является частью европейской сети геопарков.
После вступления Хорватии в ЕС все охраняемые территории, а также те, которые были признаны ценными, стали частью экологической сети наземных и морских объектов "Природа 2000".
Эндемическая флора и фауна
Флора Хорватии характеризуется биологическим разнообразием (биоразнообразие). По количеству найденных видов растений Хорватия опережает большинство европейских стран. В связи с климатическими различиями и расположением прибрежных районов Средиземноморского региона растительность в этих районах существенно отличается по составу и внешнему виду от низменных и горных районов в стране. Это особенно заметно в лесной растительности, но также проявляется и в других типах почвенно-растительного покрова.
Наряду с биологическим разнообразием важна флора имееют свою особенность, заключающуюся в большом количестве эндемических видов, расположенных в основном на Адриатических островах и горных хребтах Биоково и Велебит. В Хорватии насчитывается 8 871 вид и подвид хорватской флоры (по некоторым оценкам, более 10 000 видов), из которых 526 (около 6%) являются эндемическими и 1 088 (около 12%) охраняются.
Эндемические виды встречаются почти во всех группах животных, но большинство из них обитает в карстовом регионе и реках, впадающих в Адриатику, а также на островах. В карстовых реках Адриатического слияния встречаются 88 видов рыб, 41 из которых являются эндемическими, и более 50% рептилий –также являются эндемическими.