Комплекс ядерной поры обеспечивает обмен веществ и ионов между цитоплазмой и ядром. Известно, что ядро имеет двойную мембрану, и там, где две мембраны сливаются, образуется пора. Но пора - это не просто отверстие в ядерной оболочке. Это сложная структура, которую удалось установить только с помощью электронного микроскопа и протеомного анализа на изолированном комплексе ядерной поры.
Комплекс ядерной поры состоит из 456 различных белков, которые включают 34 нуклеопорина.
Части комплекса ядреной поры включают внешнюю цитоплазматическую область и цитоплазматические филаменты, цитоплазматическое кольцо, центральную часть (коровую часть), ядерное кольцо и ядерную корзину. Кроме того, имеются еще и специальные филаменты (ядерные филаменты), которые протягиваются из цитоплазматического кольца через центральную область и ядерное кольцо в ядерную корзину.
Для транспорта макромолекул через ядерную пору требуется система RAN-GTPase, а также рецептор ядерного транспорта импортин.
Белки с ядерной сигнальной последовательностью распознаются молекулой импортином а и транспортируются через ядерную пору. Транспорт облегчается за счет связывания импортина а с импортином b, и взаимодействия с комплексом RAN-GTP. После того, как переход в ядро произошел, комплекс RAN-GTP превращается в RAN-GDP (при помощи RAN-GTPase), а белок высвобождается в ядро.