Международной команде ученых удалось собрать геном мамонта возрастом 52 тысячи лет. Так подробно ДНК древних образцов не восстанавливали еще никогда: большинство обнаруженных древних фрагментов ДНК короче приблизительно в 1 000 000 раз.
Научную работу вчера опубликовали в журнале Cell. Потрясающе детализированная структура сохранилась случайно: когда этот мамонт умер, его ДНК быстро замерзла, высохла и осталась в состоянии, похожем на стекло.
Как правило, древние образцы ДНК состоят из очень маленьких, разрозненных фрагментов. Опираясь на работы по созданию трехмерной структуры генома человека, ученые решили, что подходящий образец древней ДНК можно использовать, чтобы теми же методами собрать древний геном.
Исследователи 5 лет проверяли множество образцов, пока не остановились на шерстистом мамонте, которого раскопали в Сибири в 2018 году. Чтобы воссоздать архитектуру его генома, исследователи применили модернизированный метод Hi-C, который назвали PaleoHi-C. Он позволяет определить, какие участки ДНК могли быть рядом друг с другом и взаимодействовать в ядре.
Ученые сравнивают работу по сборке генома со сборкой пазла из трех миллиардов кусочков без изображения, которое должно получиться в конце. PaleoHi-C дал им хотя бы общее представление.
Затем исследователи объединили эти сведения с секвенированием ДНК, что позволило создать упорядоченную карту генома. Как образец использовали геном слонов.
Выяснилось, что у мамонтов, как и у нынешних слонов, было 28 хромосом. При этом клетки кожи отличаются характером активации генов, в том числе тех, что связаны с шерстяным покровом и устойчивостью к холоду. Это первое измерение клеточной активности генов в древнем образце ДНК.
Хотя ученые и использовали окаменелость, которая сохранилась необычайно хорошо, они с оптимизмом ожидают, что метод можно будет использовать и для анализа ДНК других древних образцов, например, египетских мумий.
Читайте также:
Исследования показали, что витамин D может увеличить силу мышц
Японцы хотят построить космический лифт — появилось видео, как он может выглядеть
Ученые показали на видео искусственные мышцы для мягких, безопасных и дешевых роботов
Ссылка на статью: https://newkhakasiya.online/news/2024-07-12/uchenye-vpervye-v-istorii-sobrali-genom-neveroyatno-horosho-sohranivshegosya-mamonta-5136616