14 сентября 1869 года на первом этаже дома Э.И. Тотлебена на ул. Екатерининской открыт Музей Севастопольской обороны. Ныне музей Черноморского флота. В течение 25 лет экспозиция музея размещалась в пяти комнатах дома, принадлежавшего генералу Э.И.Тотлебену. В двух первых комнатах были размещены 20 больших карт и схем, по которым можно было проследить всю севастопольскую кампанию — от высадки десанта в Евпатории до отхода русских войск на Северную сторону.
В следующих трех комнатах были представлены литографированные портреты участников обороны, модели кораблей, личные вещи руководителей обороны, предметы вооружения и обмундирования.
В 1895 года по решению Военно-морского ведомства для музея было построено специальное здание, которое сохранилось до наших дней.
При музее в 1874 году были построены школа на 40 учеников (преобразованная затем в ремесленное училище), приют для инвалидов, школа соломоплётения для девочек и Ксениинская церковно-приходская школа на 300 учащихся. И музей, и все благотворительные учреждения находились в ведении и под покровительством Великого князя Александра Михайловича.