Семилетняя война, начавшаяся в 1756 году, привела к значительным изменениям на политической карте мира того времени. Россия, как одна из великих европейских держав, принимала в ней активное участие. Военные действия были столь масштабны, а их география так широка, что Уинстон Черчилль называл ее "настоящей первой мировой войной".
Прусский король Фридрих II, в союзе с Англией и Ганновером воевал с коалицией, включавшей Австрию, Францию, Россию и их союзников. Фридрих II язвительно называл эту коалицию «союзом трёх баб» (Мария-Терезия, Елизавета и мадам Помпадур), однако в первые годы военное счастье было на их стороне.
В своем первом походе 1757 году российская армия под командованием фельдмаршала Апраксина разбила прусские войска в сражении у деревни Гросс-Егерсдорф, а во втором заняла Пруссию и Кенигсберг, не встречая серьезного сопротивления.
Так Кенигсберг впервые стал российским. Командовавший тогда российской армией генерал - аншеф Виллим Виллимович Фермор, торжественно въехал в город, а представители прусских властей преподнесли ему ключи от ворот Фридрихсбургской крепости.
Вскоре все граждане Кенигсберга присягнули на верность русской императрице Елизавете Петровне. Среди них был и великий немецкий философ Иммануил Кант, имя которого теперь носит местный университет. А отец знаменитого полководца Александра Суворова - Василий Иванович Суворов был генерал-губернатором Восточной Пруссии в 1761-1762 годах.
Победители весьма снисходительно относились к местному населению. Горожанам было разрешено поступать на русскую государственную службу, они свободно занимались торговлей и посещали свои церкви. В Кенигсберге был основан православный монастырь. Начали чеканить монету с изображением Елизаветы и подписью: Elisabeth rex Prussiae.
Но, после смерти императрицы Елизаветы Петровны, на престол в России взошел ярый поклонник прусского короля Петр III. Антипрусская коалиция развалилась, а по трактату от 5 мая 1762 года Петр III безоговорочно отдал Фридриху II все территории, прежде занятые русскими. 5 июля 1762 года кенигсбергская городская газета уже вышла с прусским гербом.
Вскоре начался постепенный вывод российских войск, дела передавались прусским чиновникам, а в крепости заходили прусские гарнизоны. 15 февраля 1763 года подписанием Губертусбургского мира завершилась Семилетняя война.