Здравствуйте, дорогие мои читатели!
Чтобы по-настоящему, глубоко понять, как работает человеческий организм—и как возникают болезни—вам понадобится необычайное количество информации. Вы должны были бы знать идентичность каждого типа клеток в каждой ткани; точно, какие гены, белки и другие молекулы активны в каждом типе; какие процессы контролируют эту активность; где именно расположены клетки; как клетки обычно взаимодействуют друг с другом; и что происходит с функционированием организма, когда генетические или другие функции клетки претерпевают изменения. Создание такой информативной, сложной базы знаний может показаться невозможным. И все же широкий международный консорциум исследовательских групп сделал первые шаги к созданию именно этого. Эту базу данных называют Атласом человеческих клеток.
Консорциум провёл своё первое совещание по планированию в октябре 2016 года и продолжает работу над его работой. «Инициатива Чан Цукерберг» (CZI) — благотворительная организация исполнительного директора Facebook Марка Цукерберга (Mark Zuckerberg), объявила, что оказывает финансовую и инженерную поддержку в создании открытой платформы по координации исследований структурировании базы данных с целью всеобщей доступности полученных результатов, так что они будут легко доступны исследователям в рамках проекта и за его пределами.
Атлас, который будет объединять информацию из существующих и будущих исследовательских проектов, станет технически осуществимым благодаря множеству технологических достижений, включая достижения в области инструментария для выделения отдельных клеток, профилирования белков в одной клетке в любой момент времени (белки являются основными рабочими лошадками в организме) и быстрого и недорогого секвенирования ДНК и РНК.
Он будет включать в себя исследования, изучающие все "ОМЭ": геном(полный набор генов), транскриптом (РНК, полученная из генов), протеом (белки), метаболоме(малые молекулы, такие как сахара, жирные кислоты и аминокислоты, участвующие или генерируемые клеточными процессами). И эти результаты будут сопоставлены с различными подобластями клеток. Интегрированные результаты должны привести к созданию инструмента, который будет моделировать все типы и состояния клеток в нашем организме и обеспечит новое понимание процессов болезни и способов вмешательства в них.
Одним из самых передовых проектов, лежащих в основе атласа клеток человека, является атлас белков человека, в котором участвуют исследователи из многих стран, включая Швецию, Данию, Южную Корею, Китай и Индию. Этот проект, который постоянно обновляется, даёт представление о той работе, которая идёт на создание атласа клеток человека, и о его чрезвычайной ценности
Участники проекта по созданию Атласа белков человека классифицировали подавляющее большинство генов, кодирующих белки у людей, используя комбинацию геномики, транскриптомики, протеомики и профилирования на основе антител, которые идентифицируют местоположение. С момента создания программы в 2003 году около 100 человеко-лет разработки программного обеспечения ушло на отслеживание данных и организацию их системного анализа. Более 10 миллионов изображений были созданы и аннотированы сертифицированными патологами.
Белковый атлас включает в себя карту высокого разрешения расположения более 12 000 белков в 30 субклеточных компартментах, или органеллах, различных клеток. Все полученные результаты доступны исследовательскому сообществу без каких-либо ограничений. Пользователи могут запросить базу данных, чтобы исследовать белки в любом крупном органе или ткани, или они могут сосредоточиться на белках с определёнными свойствами. Эти данные также могут помочь моделировать множество динамических, взаимодействующих компонентов, которые обеспечивают жизнь и могут быть использованы для изучения идей для новых методов лечения.
Составление атласа клеток человека будет нелёгким делом, но он станет неизмеримо ценным инструментом для улучшения и персонализации медицинской помощи.
Дорогие читатели!
Комментируйте!
Ставьте лайк, если тема заинтересовала и понравилась!
Делитесь с друзьями и, подписывайтесь, дабы не потерять канал!
Те же, кто заинтересовался, и не прочь ознакомиться с оригиналом статьи, может перейти по ссылке:«Human Cell Atlas Opens a New Window to Health and Disease».
