Пока Хорти отбивался от немецких требований послать на Восточный фронт новые войска, по его поручению премьер-министр Миклош Каллаи стал налаживать связи с западными союзниками. Еще в конце 42-го года в Швейцарию прибыл Аллен Даллес, который по поручению правительства США должен был связаться с правительствами восточноевропейских стран и лидерами движения сопротивления на предмет будущего устройства этого региона. В июле 1943 года в Берн прибыл глава венгерского национального банка Липот Бараняи, который должен быть объяснить американцам, что в нынешних условиях Хорти вынужден сотрудничать с Третьим рейхом. Одновременно, Каллаи передал союзникам через Турцию меморандум, в котором Венгрия обязалась выйти из войны как только англо-американские войска достигнут ее границ.
С сентября 43-го года между англо-американскими представителями в Стамбуле и Будапештом поддерживалась постоянная радиосвязь. 12 февраля 1944 года Хорти попросил у Гитлера разрешения отвести в Карпаты все венгерские части, действовавшие на Востоке. К этому времени регент окончательно решил вести боевые действие в Венгрии против СССР без помощи немцев. Через два дня после обращения к фюреру он приказал тайно мобилизовать две пехотные дивизии и две горнострелковые бригады.
В ответ на это Адольф Гитлер отдал приказ о форсировании разработки плана оккупации Венгрии, который под кодовым названием «Маргарита-I» был подписан фюрером 12 марта. Незадолго до полуночи 18 марта 11 немецких дивизий под командованием генерала фон Вейхса вступили на территорию Венгрии. В течении 12 часов части вермахт, почти не встречая сопротивления, оккупировали все венгерские города и села.
Вскоре после этого на фронт была отправлена 1-я венгерская армия генерал-полковника Белы Миклоша обшей численностью более 300 тысяч человек. Первоначально она вела бои в междуречье Днестра и Серета, а затем заняла обороны в северо-восточных отрогах Карпат. В начале сентября 44-го года была сформирована 3-я венгерская армия генерал-полковника Йожефа Хеслени (110 тысяч человек), которая была дислоцирована вдоль венгеро-румынской границы. Одновременно было закончено переформирование 2-й венгерской армии генерал Лайош Вереш (200 тысяч человек), которая была брошена в бои за Северную Трансильванию.
23 сентября 1944 года Советская Армия вступила на территорию Венгрии. За день до этого Хорти направил в расположенный близ Неаполя англо-американский штаб генерал-полковника Иштвана Надаи, которому было поручено предложить союзным войскам высадиться в Риеке, а оттуда через Загреб пройти в Южную Венгрии. Регент, не зная о договоренностях союзников не принимать капитуляций по отдельности, был согласен подписать сепаратный мир с западными союзника, продолжая сражаться с Красной Армией. Однако, советские войска уже вышли на венгерскую границу, и 23 сентября Хорти поручил Лайошу Верешу послать в Москву делегацию во главе в бароном Эде Ацелом.
Сталин поставил перед венграми два условия: разрыв отношений в Германией и ввод в страну советских войск. После некоторых раздумий, Миклош Хотри выслал в Москву вторую, более представительную делегацию. К 9 октября советские войска, форсировав Тису, вела битву за Дербенец, угрожая полным окружением 1-й и 2-й венгерским армиям. Через три дня, 12 октября 1944 года, венгры подписали перемирие.
Узнав об этом, Гитлер вызвал к себе оберштурмбаннфюрер СС Отто Скорцени и приказа ему отстранить Хорти от власти, передав бразды правления Салаши. Скорцени разработал операцию «Панцерфауст», в соответствии с которой планировалось захватить сына Хорти и шантажировать адмирала до тех пор, пока он сам не уйдет в отставку. По замыслу Гиммлера, который был автором этого плана, сына регента, выдававшего себя за активного участника сопротивления, гестаповцы хотели заманить на встречу с «представителем Тито» и похитить его. Местом «встречи», назначенной на утро 15 октября, Отто Скорцени выбрал квартиру на площади Эшкю.
Из предосторожности Хорти-младший расположил под мостом Эржебет роту своей личной охраны. Однако, это его не спасло. Как только автомобиль остановился перед домом и из него вышел сын регента, на него кинулись агенты Скорцени. Они быстро перестреляли сопровождавших Хорти телохранителей, запихнули его обратно в машину и увезли в отделение гестапо. Когда солдаты услышали звуки стрельбы и выбежали из под моста, один из гестаповцев направил их в противоположную сторону.
Узнав о происшедшем, адмирал Миклош Хорти затворился в крепости и передал в штабы 1-й и 2-й армий приказ прекратить сопротивление частям Советской Армии. Однако, на следующий день его резиденция была окружена парашютистами Скорцени, 22-й конной дивизией и 2-й танковой бригадой. Под дулами «тигров» Миклоша Хорти заставили подписать документ о «добровольной» передачи власти в стране Ференцу Салаши. 17 октября спецпоезд вывез Хорти вместе с семьей и свитой в Баварию.
Из 10 венгерских генерал-полковников девять отказались служить Салаши и перешли на сторону Красной Армии. Из 20 генерал-лейтенантов работать на немцев согласились только трое. Сразу после отстранения Хорти от власти весь штаб 1-й армии вместе со своим командующим перешли линию фронта. 18 января 1945 года после трехнедельных боев Будапешт был взят, а через два с половиной месяца вся территория Венгрии была очищена от немецких войск.