Хабиб Нурмагомедов родился в дагестанском селении Сильди в 1988 году. Многие его родственники по отцовской линии занимались борьбой и боевыми искусствами. Отец Абдулманап Нурмагомедов — мастер спорта по вольной борьбе, заслуженный тренер России и старший тренер сборной команды республики Дагестан по боевому самбо. Первым тренером Хабиба стал именно отец. В 2001 году семья переехала в Махачкалу. В подростковом возрасте Хабиб заинтересовался боями без правил, однако под началом отца занимался самбо, а у Джафара Джафарова брал уроки дзюдо.
В 2007 году юноша решил закончить спортивную карьеру, чтобы начать зарабатывать деньги, но отец уговорил талантливого борца остаться и взял все расходы на подготовку юноши к соревнованиям на себя. В 2008 году Хабиб впервые вышел на ринг и за последующие три года получил несколько крупных наград, в том числе звание чемпиона Европы по армейскому рукопашному бою, чемпиона Европы по панкратиону.
С 2012 года Нурмагомедов начал выступать под эгидой UFC, выигрывая у таких именитых бойцов как Глейсон Тибау, Тиагу Таварис, Абель Трухильо и Пэт Хили. В 2014 году спортсмен получил травму колена и почти на год отказался от схваток. Спустя год Хабиб сломал ребро и снова выбыл из соревнований.
В 2018 году состоялся матч Хабиба против ирландского борца Конора МакГрегора. Незадолго до соревнований у спортсменов состоялась словесная перепалка. После победы российского борца тренер МакГрегора Деннис Диллон выкрикнул оскорбление Нурмагомедову, и Хабиб, перепрыгнув через ограждение, напал на Диллона. В результате началась драка между поклонниками МакГрегора и поклонниками Хабиба.
Хабиб женился в 2013 году. В 2015 году у него родилась дочь, в 2017 году — сын.
Большое место в жизни Нурмагомедова занимает религия. Боец исповедует ислам и следует его обычаям: не употребляет алкоголь и не курит.
Нурмагомедов не раз выражал свое нелицеприятное мнение о представителях российского шоу-бизнеса. В 2018 году он оскорбительно высказался по отношению к Егору Криду и Тимати. В 2019 году в его Instagram* появился пост с призывом запретить в Дагестане показ спектакля «Охота на мужчин» режиссера Владимира Моташнева. Впоследствии пост был заменен черным квадратом. Иван Жидков, актер и продюсер спектакля, публично принес извинения, при этом подчеркнув, что получил угрозы в личные сообщения Instagram(запрещенная организация на территории рф)*.