Озеро находится на территории Валдайского национального парка в Новгородской области. Вся территория нацпарка разделена на зоны заповедного режима, особо охраняемые, рекреационные и хозяйственного назначения.
Озеро до сих пор находилось в рекреационной зоне, но в связи с ухудшением экологического состояния озера, зарастанием водной растительностью из-за возросшей антропологической нагрузки было принято решение о создании еще одной особо охраняемой зоны в которую вошла примерно половина Валдайского озера (Долгобородский плес).
С 3 марта на Долгобородском плесе, расположенном за островами Паточный, Березовый и Рябиновый запрещено любительское и спортивное рыболовство, любительская и спортивная охота и пребывание граждан.
На прилегающем к городу Валдайском плесе сохраняется режим рекреационной зоны и здесь можно продолжать ловить плотву, судака, окуня, снетка, налима и щуку.
