Ученые решили попытаться понять главный волнующий вопрос, что такое конкретно здоровый микробиом и нездоровый. Как генетика, экспосома (совокупность условий окр среды), образ жизни и диета формируют микробиом в здоровье и болезни.
Для этого, как пишет нам абстракт, они проанализировали состав, функции, антибиотикорезистентность и факторы вирулентности бактерий в микробиоме кишечника 8 208 голландцев из когорты, состоящей из трех поколений и включающей 2 756 семей.
Они соотнесли эти показатели с 241 фактором хозяина и окружающей среды, включая физическое и психическое здоровье, использование лекарств, диету, социально-экономические факторы, детство и текущую экспосому.
- микробиом формируется в основном под влиянием окружающей среды и совместного проживания.
- Только около 6,6% таксонов являются наследственными, в то время как дисперсия около 48,6% таксонов значительно объясняется совместным проживанием.
- Выявив 2 856 ассоциаций между микробиомом и здоровьем, они обнаружили, что, казалось бы, не связанные между собой заболевания имеют общую микробиомную подпись, которая не зависит от сопутствующих заболеваний.
- Были выявлены 7519 ассоциаций между особенностями микробиома и рационом питания, социально-экономическим положением и воздействием на организм в раннем возрасте и в настоящее время, причем многочисленные факторы раннего возраста и настоящего времени значительно связаны с функцией и составом микробиома.
В целом, данное исследование дает всесторонний обзор микробиома кишечника и лежащего в его основе влияния наследственности и воздействия, что будет способствовать будущей разработке терапии, направленной на микробиом.
Очень лаконичное понятное описание.
Поговорим чуть подробнее.
Ученые действительно пытались вычленить здоровый и нездоровый микробиом. В итоге нашли 1 206 значимых ассоциации с таксонами бактерий, 1 182 с микробными путями, 390 с генами устойчивости к антибиотикам и 76 с факторами вирулентности бактерий.
Различные заболевания имели разное количество ассоциаций, и самые сильные сигнатуры наблюдались для сердечно-сосудистых и метаболических заболеваний, таких как неалкогольная жировая болезнь печени и T2D, а также для желудочно-кишечных заболеваний, включая воспалительные заболевания кишечника и СРК. А значит мы можем на них влиять нашим образом жизни, тем, где мы живем и что мы едим.
Неродственные заболевания имели несколько общих активированных сигнальных путей микробиоты, например повышенный синтез L-орнитина, убихинола или общего антигена энтеробактерий, или уменьшение синтеза аминокислот и фрагментации до коротко-цепочечных жирных кислот.. и многие другие.
Способ рождения, грудное вскармливание и недоношенность влияли на микробиом, но в гораздо меньшей степени, чем урбанизация в детском возрасте или курение родителей.
Владение домашними животными в детстве было связано с микробиомом взрослых.
Также безусловно болезни и медикаменты, что принимает человек. Особое влияние оказывали ингибиторы протонной помпы (ИПП), антибиотики, бигуанидные противодиабетические препараты, осмотические слабительные и кишечные противовоспалительные средства.
ЗАметьте, я не пишу в какую сторону, хорошую/плохую(это в принципе и так понятно), речь об изменении сигнатуры, состава, одни виды уменьшаются, другие увеличиваются. Вот, посмотрите на табличку, какие факторы влияют на состав микробиоты голландцев:
Ученые исследовали также экологические факторы во время отбора проб и выявили общие ассоциации сигнатур "здорового" микробиома с владением домашними животными, сельской средой проживания и площадью озелененной поверхности в жилой среде.
Понятие здоровый микробиом относительно, нужно понимать, что речь идет о соотношении основных таксонов, на точки опоры. "Здоровый" состав в меньшей степени ассоциирован с болезнями. Грубо говоря сравнивали ассоциации между микробиомом, здоровьем и различными заболеваниями и выявили наиболее безобидный вариант.
Также выявили 220 ассоциаций между социально-экономическими факторами (например, ежемесячный доход и доход района) и микробиомом кишечника, из которых 72 были связаны между обилием бактерий и ежемесячным доходом. В общем, у голландцев так: чем богаче, тем здоровее микробиот, и живете вы при этом в очень зеленом месте или в сельской местности (голландские домики.. зеленые просторы голландских полей.. вот это вот все). Ну и безусловно питание. Голандские коровки и селедочка ( это я шучу, сельдь в исследование не попала).
Это исследование подтвердило ранее известный постулат, что микробиом регулируется факторами среды, в которых живет особь, нежели генетикой.
Мои научные фантазии
Были выявлены общие микробиомные паттерны между совместно проживающими членами семьи и их домашними животными.
Рассчитывать на то, что ваши бактерии в кишке отличаются от тех, что у мужа– не приходится, примерно половина у вас общая. Тут в пору подумать о "совместимости", ведь иммунная система разная у всех, она как раз наследуется и ее определяет генетика в гораздо бОльшей степени.
Я о чем? Созревание иммунной системы и дальнейшее поддержание толерантности в течение жизни (привет и аллергии и аутоиммунные, метаболические и даже в какой-то степени онкологические болезни)– прямая заслуга кишечника. Но. Но кишечник не может перепрыгнуть через генетику. И если у человека набор генов иммунной системы «ну так себе», например какая-то вариация, в каком-то нужном гене иммунной системы, что ослабляет производство важной молекулы. Молекула есть, но маловато. Иммунная система и рада бы научится на отлично толерантности к какому-то белку, но не получается. Случается болезнь. Или не случается, тк бактерии хорошие, стараются, человек их поддерживает зожем, и все у них ок, эта вариация компенсируется и все здоровы.
И тут человек начинает жить с партнером. У партнера другие микробы, другие гены в иммунной системе, все другое. Живя вместе вы что-то передадите, он что-то передаст, вы "сравняетесь". И передать он может нечто, что на вашу иммунную систему и организм в целом– система не выдержит и с течением времени болезнь (нарушение толерантности к чему-либо, нарушение регуляции иммунной системы бактериями) возьмет свое, которой могло бы и не быть...... Такое возможно, как вы думаете? что мы будем выбирать партнеров по какашкам?
Напоминаю, это фантазия. Никаких таких исследований нет. И я думаю, они мало возможны сегодня.
Что в итоге?
Общая сигнатура микробиома предполагает, что вмешательства, направленные на микробиом, могут улучшить общее состояние здоровья человека. Снова ЗОЖ, жить в селе и иметь возможность нормально питаться, заниматься спортом, и много не нервничать. Да, мы опять пришли не к БАДам и пробиотикам (кстати они слабо влияли на состав, пробиотики), а к образу жизни.