Каменная одноглавая церковь в классическом русском стиле была построена в Никольском в 1858–1862 годах. Имя автора проекта храма в Никольском неизвестно. Церковь имеет черты «неорусского» стиля, характерного для творчества зодчих 1850–1860-х годов. В 1862 году строительство и внутренняя отделка церкви Рождества Пресвятой Богородицы в селе Никольском-Трубецком были завершены и, по благословению митрополита Филарета, храм освятил епископ Дмитровский Леонид. Церковь достраивалась на средства фабрикантов Каулина и Хлудова, владевших в округе ткацкими фабриками. Ну а многолетним ктитором храма был председатель правления Балашихинской мануфактуры Павел Григорьевич Шелапутин.
Шелапутина смело можно назвать одним из богатейших людей Москвы конца XIX – начала XX века. В 26 лет, в 1874 году, Павел Григорьевич вместе со своим родственником по линии сестры купцом Карзинкиным стал одним из организаторов и учредителей «Товарищества Балашинской мануфактуры». С самого основания товарищества Павел Григорьевич руководил всеми делами производства, наращивая его и развивая. При Балашихинской фабрике Шелапутин построил дома для рабочих, больницу, потратил более 60 000 рублей на постройку дома призрения престарелых рабочих на 120 мест. Некоторые из построенных им зданий (прежде всего в микрорайоне Балашиха-2) до сих пор служат людям.
В течение 1892–1898 годов на средства Товарищества Балашинской мануфактуры в Никольском построили дома для причта Богородицерождественской церкви: бревенчатый одноэтажный дом священника на каменном фундаменте (1892); бревенчатый, обшитый тёсом, на каменном фундаменте дом диакона (1896); бревенчатый, на каменном же фундаменте дом псаломщика (1898). По ходатайству церковного старосты П.Г. Шелапутина в 1896 году Московская Духовная Консистория разрешила открыть в Богородицерождественском храме диаконскую вакансию, и причт с того времени состоял из священника, диакона и псаломщика.
К счастью, в советское время церковь в Никольском-Трубецком не закрывалась, хотя к 1940 году в Реутовском районе оставались действующими лишь пять храмов. В храме два придела: во имя святителя Николая и святых первоверховных апостолов Петра и Павла. Деревянные вызолоченные иконостасы сохранились до наших дней.