Предание гласит Варницкий монастырь основан на месте дома преподобных Кирилла и Марии, родителей преподобного Сергия Радонежского, где он родился и жил с родителями и братьями, недалеко от города Ростова Ярославской области на берегу реки Ишня.
Церковь во имя преподобных Кирилла и Марии (родителей Сергия ) над северными вратами монастыря появилась уже в наши дни, после возвращения монастыря Церкви.
Троица-Сергиева пустынь была основана в 1337 году Варфоломеем (Сергий Радонежский) и его старшим братом Стефаном. Они поселились на холме Маковец, в десяти верстах от Хотькова. Вскоре братьями был поставлен деревянный храм во имя Святой Троицы и был освящен в 1340 году. После ухода Стефана в Богоявленский монастырь в Москву, преподобный Сергий несколько лет подвизался в одиночестве. И вскоре вокруг его кельи стали селиться другие иноки. Около 1340 года пустынь превратилась в особножительный монастырь. Константинопольский патриарх Филофей благословил преподобного Сергия ввести общежитийный устав. Монастырская территория была разделена на три части: жилая, общественная и оборонительная. Игуменом монастыря сначала был Митрофан, подстригший Варфоломея под именем Сергия. После смерти Митрофана игуменом монастыря стал преподобный Сергий Радонежский.
Прямо рядом с ракой находится темная сводчатая двустворчатая кованная железная дверь, это вход в Серапионову палату - совершенно чудное и потрясающее во всех отношениях место, где хранится огромное количество православных святынь ( более пятисот). Не многие знают об этом месте. Обычно идут поклониться мощам Сергия Радонежского.
Серапионова палата - это придел Троицкого собора, где находятся основные христианские реликвии, налево - Никоновский придел.
Троицкий монастырь стал духовным центром русских земель, поддержкой московских князей. В 1380 году преподобный Сергий благословил войско князя Дмитрия Ивановича на сражение с Мамаем.
Во время Куликовской битвы - 8 сентября 1380 года на поле боя по благословению преподобного Сергия вышли иноки - богатыри Троицкого монастыря - Пересвет и Ослябя.
В 1392 году преподобный Сергий преставился и был похоронен в храме Святой Троицы. За полгода до своей кончины Сергий передал руководство монастырем своему любимому ученику Никону Радонежскому.
В 1408 году монастырь был сожжен и разграблен татарским ханом Едигеем.
- Следующие 200 лет его истории прошли почти безоблачно. В 1422 году на месте деревянной церкви, игуменом Никоном Радонежским было заложено первое каменное сооружение монастыря - Троицкий Собор, построенный силами сербских монахов из Косово, нашедших прибежище в монастыре после битвы на Косовом Поле.
- При строительстве собора были обретены мощи преподобного Сергия Радонежского. Храм был расписан выдающими иконописцами Андреем Рублевым и Даниилом Черным. Для иконостаса собора была написана знаменитая Рублевская Троица .
- В Троицком соборе совершались молебны перед походами и по успешном окончании их.
