В последние годы в научной литературе обсуждается влияние микрофлоры кишечника на функционирование организма (главным образом функционирование иммунной системы, работа нервной системы, доступности нутриентов). Представители микрофлоры кишечника активно участвуют в метаболизме нутриентов. Микробиота кишечника играет важную роль в облегчении процесса переваривания и всасывания белков/аминокислот путем разложения сложных субъединиц на простые. Бактериальные ферменты делают питательные вещества легко усваиваемыми для организма. Кроме того, бактерии, колонизирующие кишечник, способны способствовать синтезу незаменимых аминокислот, которые в последствии поступают в кровоток и могут учавствовать в биосинтезе белков организма. На состав микробиоты кишечника влияют многочисленные факторы, в том числе состояние организма и факторы окружающей среды. Одним из основных факторов является рацион. Показано, что количество употребляемого с пищей белка/аминокислот оказывает влияние на видовой состав мик