Разделение стационаров на зоны является условным обозначением помещений, где выполняется определённый характер медицинских работ, которые по эпидемиологически соображениям должны быть отделены друг от друга.
Под "чистой" или "зелёной" зоной обычно подразумевает чистую или стерильную область, свободную от инфекционных и гнойных больных (или от пациентов вовсе), "грязная" или "красная" зона отличается наличием контагиозных заболеваний, особо опасных инфекций и различных биологических агентов, которые необходимо держать под контролем и ограничить контактами из вне. Это определяет эпидемиологическую безопасность. Данные зоны разделяются отдельными входами, шлюзами, санпропусками и вентиляцией. В зонах существуют требования к спецодежде и средствам индивидуальной защиты. В каждой из зон своя эпидемиологически обстановка, поэтому переход из одной зоны в другую без смены защитной одежды и санитарной обработке запрещен.
Однако понятие зон довольно относительно и не всегда включает все вышеперечисленные требования, более того несколько зон могут находится даже в одном помещении. Например, в процедурном кабинете СанПин выделяет "чистую" зону в виде места для хранения препаратов, "рабочую" для выполнения манипуляций и "грязную" в виде области для дезинфекции и сбора отходов. В отделении ЦСО есть "грязная" зона для приёма инструментов и их мытья, а также "чистая" и "стерильная" зоны, где происходит контроль изделий и упаковка инструментов. Разделение областей на "чистые" и "грязные" существуют даже в условиях участков по обращению с медицинскими отходами. Поэтому требования работы и принципы безопасности будут зависеть от характера помещения или области, в которой происходит деятельность.
Классы чистоты помещений отличаются от разделения помещений на зоны и определяются как требования к уровню допустимого микробного загрязнения. Всего существует четыре класса чистоты : А, Б, В, Г. Первый два класса с особыми требованиями к низкому количеству микроорганизмов. К ним относятся родовые блоки, операционные, перевязочные и т.д. К классам В и Г относят прочие медицинские помещения, уровень микроорганизмов в которых не регулируется. Все классы чистоты могут присутствовать как в "грязных", так и "чистых" зонах.