Есть только один объективный фактор по которому можно определить лучшую команду россии в 21 веке-это европейские трофеи. В 21 веке европейские трофеи завоевывали только две российские команды: Зенит и ЦСКА. Обе команды выиграли Кубок УЕФА, но Зениту в отличие от ЦСКА еще удалось выиграть и Суперкубок УЕФА, так как Зенит единственная российская команда выигравшая Суперкубок-это позволяет считаться ей лучшей российской командой в 21 веке.
Главными звездами той команды были российские игроки: Аршавин, Анюков, Погребняк, Зырянов, Денисов, а в центре поля играл один из лучших опорников европы Анатолий Тимощук, чуть позже к команде присоединился Данни с целью заменить Аршавина и это у него прекрасно получиться. В то время команда показывала яркий атакующий футбол и всегда старалась играть от себя не зависимо от уровня соперников, из-за чего и влюбила в себя множество болельщиков.
В таком составе команда просуществовала недолго, вскоре после триумфа в суперкубке Аршавин отправился в Англию, Погребняк и Тимощук уехали в Германию, в последствии в отставку был отправлен главный тренер Дик Адвокат. С приходом Спаллетти в Зените началась новая эра, команда продолжала показывать яркий футбол, в клуб вкладывались большие деньги, но добиться результата в европе так и не удалось. Руководство клуба изменило свою трансферную политику и стало больше ориентироваться на европейский рынок, пытаясь сделать из Зенита топовую европейскую команду, но в последствии из-за частых неудачных трансферов Зенит так и не стал топовой европейской командой, да еще и потерял основной российский костяк игроков.