Основной резиденцией считается усадьба, расположенная в поселке Переделкино. На участке в два с половиной гектара находится главное трехэтажное здание и прилегающие к нему отдельные постройки, включающие: личные апартаменты, залы для приема, домовую церковь, гостиницу, бытовые помещения и оздоровительный комплекс, а также стоянку и бокс для хранения продуктов.
На территории находится пруд и парковая зона со скульптурами и хоз. постройками бытового назначения.
Усадьба меблирована люксовыми предметами интерьера, привезенными из Италии, а фасад здания напоминает Теремной дворец в Кремле.
Председатель ОВЦС много путешествует по городам России и ведет просветительскую деятельность, поэтому у него нет постоянного места жительства. Основными местами, где он останавливается, считаются: Свято-Данилов монастырь, Троице-Сергиева лавра, резиденции на Валааме и в Чистом переулке для рабочих встреч, а также несколько особняков: на Соловках, в Троице-Лыково и на Рублевке.
Квартира Патриарха Кирилла
Президент Борис Ельцин решил улучшить жилищные условия Кириллу и подогнал Гундяеву пятикомнатную квартиру размером в 140 квадратов. Жилплощадь находится в знаменитом «Доме на набережной» по улице Серафимовича дом 2. Здесь он не живет и никогда не жил. Изначально, подаренное имущество было в плохом состоянии и не пригодно для жилья. Со временем квартиру привели в порядок и перевезли сюда на хранение собрание раритетных книг, которые еще в советское время начал собирать отец Кирилла.
Квартира находится на самом верхнем этаже здания и имеет великолепный вид на храм Христа Спасителя. Это единственная недвижимость, официально принадлежащая Владимиру Гундяеву. Квартиры по адресу Серафимовича, 2 размером более 100 квадратов до 300 млн. руб.