Теперь пришло время подробнее поговорить о признаках на филогении. Это очень важно по двум причинам. Во-первых, положение признаков на филогении может дать нам понимание того, насколько наша филогения адекватна. Если вы видите, что какой-то сложный признак возникает на ней более одного раза, то может возникнуть подозрение, что что-то пошло не так. Во-вторых, эволюция признаков сама по себе может быть одной из целей филогенетического исследования. Как кодировать признаки я объясняла ранее: Часть 1 и Часть 2...

Монофилия - это одно из центральных понятий в филогенетике, и оно принципиально важно для интерпретации полученных результатов. Естественная группа с общей эволюционной историей - это по сути монофилетическая группа. И это то, что мы пытаемся понять, является ли изучаемая группа естественной или нет. Я здесь следую трактовке Хеннига, и даю определения согласно кладистической парадигме. Монофилетической называется группа, которая включает предка и всех его потомков. Монофилетическая группа это синоним термина "клада", потому что клада по определению монофилетична...