Исследование геномов 15 тысяч жителей Латинской Америки выявило 35 генов, варианты (мутации) в которых ассоциированы с расстройствами аутистического спектра (РАС). Интересно, что для многих из этих генов была показана ассоциация с РАС и в популяциях европейского происхождения. Сходство генетической архитектуры аутизма в разных этнических группах подтверждает представление о том, что биология этого состояния универсальна.
Почему Латинская Америка?
Гены, связанные с риском развития аутизма, в значительной степени одинаковы европейцев и латиноамериканцев. Это показало одно из самых масштабных на сегодня геномных исследований лиц латиноамериканского происхождения, которое провели сотрудники Медицинской школы Айкана в Маунт-Синай вместе с коллегами из других научных учреждений.
Большая часть генетической предрасположенности к расстройствам аутистического спектра (РАС) обусловлена распространенными генетическими вариантами. Однако существенный вклад в индивидуальную предрасположенность вносят редкие варианты, часто возникающие de novo. (присутствующие у ребенка, но отсутствующие у его родителей). Эти гены изучаются многими научными группами: они важны как для диагностики, так и, в очень отдаленной перспективе, для лечения. О внедрении в клинику персонализированной терапии речи еще не идет, но разработки активно ведутся.
Однако большинство этих открытий было сделано на когортах, включающих в основном лиц европейского происхождения, которые составляют лишь 16% населения Земли. Вопрос о других популяциях оставался открытым.
Для решения этой проблемы авторы статьи создали консорциум «Геномика аутизма у лиц латиноамериканского происхождения» (GALA) и проанализировали данные о геномах более 15 000 жителей Латинской Америки, среди которых примерно у 4700 человек было диагностировано РАС. Латиноамериканцы — крупнейшая в мире популяция смешанного происхождения, их предками были коренные американцы, жители Западной Африки и европейцы, таким образом, генетическое разнообразие участников было весьма велико.
Что нашли?
Более 18 000 генов исследовали на предмет редких вредных вариантов в участках генома, которые кодируют белки. Слово «варианты» часто для простоты заменяют «мутациями», но при этом не стоит забывать, что некий вариант, во-первых, может присутствовать у многих людей, во-вторых, не обязательно должен быть вредным для носителя. Мутация часто воспринимается неспециалистами как «что-то уникальное и плохое», хотя может и принести пользу носителю или не повлиять ни на что и за счет этого широко распространиться в популяции. Впрочем, дальше речь пойдет именно о вредных генетических вариантах.
Авторы обнаружили тысячи редких генных вариантов, которые присутствовали у участников с диагнозом и их близких родственников. Но еще надо было выяснить, варианты в каких генах действительно могут способствовать развитию РАС, а какие, возможно, нейтральны или вовлечены в развитие других патологий. Для этого использовали биоинформатические инструменты — например, проверяли, встречаются ли те генные варианты, которые портят структуру белка (а есть и такие, которые не портят или портят незначительно), чаще у людей с диагнозом, чем без диагноза. Если да, то можно предположить, что эти белок как-то участвует в развитии РАС.
Исследователи выявили 35 генов, редкие варианты в которых надежно связаны с аутизмом, в латиноамериканской когорте. Среди них были как известные ранее гены, так и новые. Их названия представляют пока в основном академический интерес, но можно сказать, что в очередной раз подтвердилась роль сигнального пути mTOR (гены MARK2, MTOR, TSC2, YWHAG, GLS), функции синапсов нейронов и цитоскелета (DYNC1H1, PAK2, DLG4, GRIN1, SYNGAP1), регуляции активности генов (SPEN, RERE, GSE1) в развитии РАС, отмечают авторы.
Насколько велико сходство с европейскими данными?
Обнаружилось значительное пересечение с генами, идентифицированными в исследованиях геномов лиц европейского происхождения: 19 из 35 генов давали значимый сигнал и в европейских когортах с РАС. Для редких вариантов это большое пересечение. «Наши результаты показывают, что основная генетическая структура аутизма является общей для разных этнических групп», — говорит руководитель исследования Джозеф Буксбаум.
По оценке авторов, маловероятно, чтобы причиной была европейская предковая компонента в геномах латиноамериканцев, хотя этот вопрос нуждается в дальнейшем исследовании.
Читайте также на PCR.NEWS:
Распространенность аутизма может быть «побочным эффектом» эволюции мозга у людей
Темы этого материала связаны с научными исследованиями и результатами
опубликованных работ. Информация представлена исключительно в ознакомительных целях. Она не предназначена для постановки диагноза, назначения лечения или принятия медицинских решений.
Материал не содержит медицинских рекомендаций и не должен рассматриваться как руководство к самолечению. Для решения медицинских проблем необходимо обратиться к специалисту.