Исследователи из Делавэрского университета (University of Delaware, США) изучили внутренние механизмы работы ВИЧ, которые позволяют вирусу сохранять жизнеспособность. Результаты работы опубликованы в журнале Nature
Для изучения структуры вируса учёные использовали криоэлектронную микроскопию (крио-ЭМ) высокого разрешения. Этот метод позволяет визуализировать молекулы на атомном уровне. Исследование показало, что белок интеграза формирует линейные нити, которые выстилают внутреннюю поверхность капсида.
Внутри капсида находится вирусная РНК. Нити интегразы плотно сцепляются с элементами оболочки (гексамерами), работая как опорный каркас для стабилизации РНК. Структура этих нитей строго упорядочена: они строятся из повторяющихся блоков по восемь молекул (октамеров). В свою очередь, каждый такой блок собран из двух более мелких звеньев — асимметричных гомотетрамеров. Если связь между интегразой и капсидом нарушается, вирус собирается неправильно. В таких дефектных частицах РНК оказывается за пределами оболочки, из-за чего вирус теряет способность заражать клетки
Для проверки функции интегразы исследователи использовали ингибиторы ALLINI, которые мешают формированию функциональных комплексов интегразы. Учёные выяснили, что нарушение структурной функции белка делает вирус неинфекционным, что подтверждает двойную роль интегразы: ферментативную и структурную. Белок обеспечивает правильную упаковку генома и поддерживает способность вируса заражать клетки.
Учёные отметили, что обнаружение структурной роли интегразы меняет устоявшиеся представления о жизненном цикле ВИЧ. Если стандартная терапия направлена в основном на блокировку копирования вирусных генов, то теперь открывается путь к созданию препаратов, разрушающих саму архитектуру вируса ещё на этапе его созревания. Эти данные закладывают основу для разработки антиретровирусных средств нового поколения, способных предотвращать формирование инфекционных частиц.
