Огурцы — экономически важная культура во всем мире, занимающая третье место по объему производства среди овощей после томатов и лука. Однако выведение улучшенных сортов, устойчивых к болезням, идеальной формы и без пустот, остается сложной задачей.
Исследовательская группа Института Бойса Томпсона создала пангеном — самую полную генетическую карту огурца из когда-либо созданных. В отличие от традиционных подходов, использующих один эталонный геном, пангеном объединяет генетическую информацию о 39 различных сортах. Благодаря этому удалось обнаружить почти 172 тыс. крупных структурных изменений в ДНК, которые сыграли важную роль в эволюции огурца и влияют на его сельскохозяйственные характеристики.
Влияние одомашнивания огурца на геном
Исследование показало, что в процессе одомашнивания огурцов происходила активная «очистка» генома от наиболее опасных генетических мутаций, в то время как менее вредные сохранялись. Также был прослежен путь огурца от Индии по всему миру. Ученые выявили, что дикие популяции передавали свои гены европейским сортам. И этот процесс привел также к появлению нежелательных генетических изменений, которые были связаны с полезными генами.
Эти результаты имеют прямое практическое применение для селекции. Исследователи доказали, что включение данных о потенциально вредных структурных вариантах в модели геномного прогнозирования значительно повышает их точность в предсказании таких важных характеристик, как форма и пустотелость плодов, что может помочь селекционерам более эффективно разрабатывать лучшие сорта.
Изучением карантинных и других особо опасных фитопатогенов тыквенных культур занимаются в научных подразделениях Всероссийского центра карантина растений (ФГБУ «ВНИИКР» Россельхознадзора). Результатами исследований стали работы по анализу фитосанитарного риска и методические рекомендации по выявлению и идентификации патогенов.
Источник: Graph-based pangenome reveals structural variation dynamics during cucumber breeding, Nature Genetics (2026). DOI: 10.1038/s41588-026-02506-0 www.nature.com/articles/s41588-026-02506-0