Виром человека: новые маркеры иммунного статуса и воспаления

Введение

Мы проанализировали данные международных исследований и обзорных работ о вироме человека и собрали краткую «карту темы» для практикующего врача.

В материале:

• что именно понимают под виромом;
• почему современная модель уходит от логики «один вирус — одна болезнь»;
• какие связи вирома с иммунным гомеостазом и хроническим воспалением обсуждаются;
• где особенно важны ограничения интерпретации.

Долгое время вирусы рассматривались исключительно как патогены. Однако современные метагеномные исследования перевернули это представление. Выяснилось, что в теле здорового человека присутствует богатое разнообразие «комменсальных» вирусов, которые не вызывают явных симптомов, но постоянно сосуществуют с нами [1].

Вирусы — одна из самых многочисленных групп биологических объектов в организме. Понимание роли вирома рассматривается как перспективный дополнительный уровень информации при оценке иммунного статуса и хронического воспаления.

Виром человека — это совокупность всех вирусов, обитающих в организме, включая вирусы, инфицирующие человеческие клетки, и вирусы микробиоты (прежде всего бактериофаги) [1].

Физиологическая роль вирома: больше, чем просто инфекция

Предполагается, что виром может участвовать в поддержании иммунного гомеостаза. По оценкам, общее число вирусных частиц сопоставимо с суммарным числом бактериальных и человеческих клеток.

Ключевые механизмы влияния вирома на гомеостаз:

• Регуляция бактериальных сообществ. Бактериофаги, которыми особенно богат кишечник, влияют на состав бактериального сообщества и выполняют защитную функцию — они могут препятствовать чрезмерному росту патогенных бактерий [1, 2].
• Иммунный прайминг («тренировка» иммунитета). Предполагается, что виром может участвовать в поддержании иммунного гомеостаза, способствуя «тренированности» врождённого иммунитета — в частности, обеспечивая фоновую активацию интерфероновых путей и NK-клеток [1].
• Генетический вклад. В геноме человека присутствуют эндогенные ретровирусные последовательности (HERV) — «следы» древних ретровирусных инфекций. Часть этих элементов была «кооптирована» организмом: например, HERV-производные белки syncytin-1/2 участвуют в формировании плаценты и процессах слияния трофобласта [9].

Виром различных локусов как маркер патологии

Вариации состава вирома в разных средах организма могут меняться при заболеваниях и коррелировать с клиническими состояниями.

1. Кишечник.
Здесь преобладают бактериофаги (отряды Caudovirales, семейство Microviridae и др.).

Клиническое значение: Изменения кишечного вирома ассоциированы с воспалительными заболеваниями кишечника (ВЗК). Отдельные исследования также связывают изменения кишечного вирома с метаболическими нарушениями (ожирение, диабет) [2].

2. Кожа.
Основную массу здесь также составляют бактериофаги, инфицирующие кожные бактерии (Staphylococcus, Cutibacterium).

Клиническое значение: Фаги контролируют рост Cutibacterium acnes (бактерий, ассоциированных с акне). Однако у ряда кожных фагов выявлены гены антибиотикорезистентности, которые могут передаваться бактериям и влиять на их патогенность [5, 6, 7].

3. Легкие.
В ряде исследований ДНК латентных герпесвирусов (EBV, CMV) и анелловирусов выявляли в образцах из нижних дыхательных путей без признаков острой инфекции [8].

Клиническое значение: Согласно одной из гипотез, комменсальный виром лёгких может выполнять защитную функцию. Однако дисбиоз вирома (снижение разнообразия фагов и увеличение доли герпесвирусов) ассоциируется с тяжёлой астмой и худшим контролем ХОБЛ [8].

4. Плацента.
Белки Syncytin-1/2 (продукт экспрессии HERV) участвуют в слиянии клеток трофобласта и иммунной регуляции [9].

Клиническое значение: Роль двояка. С одной стороны, HERV-белки (в т. ч. синцитины) участвуют в формировании плаценты и плацентарного барьера. С другой — цитомегаловирус и другие возбудители TORCH-инфекций могут приводить к неблагоприятным исходам беременности, включая врождённую патологию. Изменения плацентарного вирома также изучаются как потенциальный фактор задержки роста плода (FGR/ЗРП) [4].

Клиническое применение знаний о вироме

Анализ вирома переходит из разряда фундаментальной науки в плоскость клинических перспектив:

• Маркеры иммунного статуса. Анелловирусы (Anelloviridae), обнаруживаемые почти у всех людей, рассматриваются как перспективные суррогатные маркеры: при выраженном иммунодефиците их вирусная нагрузка выше, чем у иммунокомпетентных пациентов [1].
• Терапия дисбиоза. При ФМТ, применяемой в отдельных клинических ситуациях (в т. ч. при рецидивирующей инфекции C. difficile), переносится не только микробиота, но и компоненты вирома (включая бактериофаги) [2].
• Мониторинг хронических заболеваний. Современные обзоры подчёркивают, что всё больше внимания уделяется не отдельным вирусам, а дисбиозу вирома — нарушениям его равновесия [1, 2].

Ограничения и перспективы

Хотя концепция вирома открывает новые горизонты, врач должен помнить об ограничениях:

1. Причина или следствие? Пока неизвестно, являются ли вирусные изменения (например, при ВЗК или астме) причиной патологии или её следствием [2, 8].
2. Технические ограничения и риск контаминации. Данные о вироме плаценты остаются предметом дискуссии из-за риска лабораторной контаминации. Именно поэтому результаты метагеномных исследований требуют осторожной интерпретации и пока относятся скорее к области исследований, чем к рутинной клинической практике [4].
3. Транзиторные находки (контекст интерпретации). В сезон респираторных инфекций в дыхательных путях транзиторно выявляют респираторные вирусы, однако такие находки не рассматриваются как часть «нормального» вирома и требуют осторожной клинической интерпретации [8].

Заключение

Глубокое изучение вирома — одно из ключевых направлений современной медицины: оно помогает раскрывать механизмы заболеваний и находить новые терапевтические подходы. Переход от упрощенной модели «один вирус — одна болезнь» к пониманию вирома как сложной экосистемы даст врачу новые ключи к диагностике и лечению сложных пациентов.

В онлайн-библиотеке для врачей от института PreventAge® доступен мастер-класс Гульнары Филатовой «Интегральный менеджмент проблемных вирусных инфекций», который поможет перевести фундаментальные знания в реальные врачебные решения.

В материале — практический разбор с опорой на современные данные о вироме: разбираем препараты, способные на него влиять, детально рассматриваем клинику, диагностику и лечение ключевых вирусных инфекций — от частых ОРВИ и гриппа до ВПЧ и герпесвирусной инфекции.

Вывод простой, но важный: виром — часть экосистемы организма, и в норме у человека присутствует разнообразие «комменсальных» вирусов. Поэтому внимание всё чаще смещается от отдельных находок к нарушениям равновесия вирома — при этом результаты метагеномных исследований требуют осторожной интерпретации и пока относятся скорее к области исследований, чем к рутинной клинической практике.

Список литературы

1. Liang, G., & Bushman, F. D. (2021). The human virome: assembly, composition and host interactions. Nature Reviews Microbiology, 19(8), 514–527.
2. Cao Z, et al. The gut virome: A new microbiome component in health and disease. EBioMedicine. 2022;81:104113. doi: 10.1016/j.ebiom.2022.104113. PMID: 35753153.
3. Ray, K. (2015). A “friendly” gut virus? Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 12(1), 6. doi: 10.1038/nrgastro.2014.220.
4. Stupak, A., et al. (2024). A Virome and Proteomic Analysis of Placental Microbiota in Pregnancies with and without Fetal Growth Restriction. Cells, 13(21), 1753.
5. Hannigan, G. D., Meisel, J. S., Tyldsley, A. S., et al. (2015). The human skin double-stranded DNA virome: topographical and temporal diversity, genetic enrichment, and dynamic associations with the host microbiome. mBio, 6(5), e01578-15.
6. Liu J, et al. The diversity and host interactions of Propionibacterium acnes bacteriophages on human skin. ISME J. 2015;9(9):2078–2093. doi: 10.1038/ismej.2015.47. PMID: 25848871.
7. Li, Z., et al. (2025). A comprehensive reference catalog of human skin DNA virome reveals novel viral diversity and microenvironmental influences. Microbiology Spectrum, 13(7): e01178-25. doi: 10.1128/spectrum.01178-25. PMID: 41025824.
8. Wang, W., Hu, H., et al. (2025). From commensalism to pathogenesis: the hidden role of the respiratory virome. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 15:1693796. doi: 10.3389/fcimb.2025.1693796.
9. Lokossou, A. G., Toudic, C., & Barbeau, B. (2014). Implication of Human Endogenous Retrovirus Envelope Proteins in Placental Functions. Viruses, 6(11), 4609–4627. doi: 10.3390/v6114609. PMID: 25421890.