Найти в Дзене

Ризофагия: когда растение ест микробов. Наука и выдумки

Если вы думали, что растения мирно сосуществуют с почвенными микробами, готовьтесь к сюрпризу. Отношения больше напоминают контролируемую эксплуатацию: приманить, впустить, атаковать, получить питание, выпустить ослабленных «доноров». Всё это — ризофагия, процесс, где корень выступает в роли стратега и скотовода. Расскажу, как это открыли и что видят учёные в микроскоп. Отделю реальные открытия от мифов
Я уже останавливался на этом моменте ранее:
Но в сети появляются сказки по этому поводу. Есть повод поговорить об этом подробней. Фото из лекции Джеймса Вайта. Растение как микробный «скотовод» Представь, что корни растения - это не просто трубки, через которые всасывается вода и минеральное питание. Это активный «скотовод», который управляет целым стадом микробов: приманивает, пасёт, частично подкармливает и... частично доит и даже ест. Звучит как фантастика, но это реальный, наблюдаемый под микроскопом процесс, который наука описала совсем недавно. Этот процесс называется ризофа
Оглавление

Если вы думали, что растения мирно сосуществуют с почвенными микробами, готовьтесь к сюрпризу. Отношения больше напоминают контролируемую эксплуатацию: приманить, впустить, атаковать, получить питание, выпустить ослабленных «доноров». Всё это — ризофагия, процесс, где корень выступает в роли стратега и скотовода. Расскажу, как это открыли и что видят учёные в микроскоп. Отделю реальные открытия от мифов

Я уже останавливался на этом моменте ранее:

Но в сети появляются сказки по этому поводу. Есть повод поговорить об этом подробней.

Фото из лекции Джеймса Вайта.
Фото из лекции Джеймса Вайта.

Растение как микробный «скотовод»

Представь, что корни растения - это не просто трубки, через которые всасывается вода и минеральное питание. Это активный «скотовод», который управляет целым стадом микробов: приманивает, пасёт, частично подкармливает и... частично доит и даже ест. Звучит как фантастика, но это реальный, наблюдаемый под микроскопом процесс, который наука описала совсем недавно.

Этот процесс называется ризофагией (от греч. «rhiza» - корень и «phagein» - есть). В сети про него уже успели понаписать чего угодно - от здравых упрощений до чистой фантазии. Ниже разберём, что именно показали реальные исследования, как это доказали и где кончается наука и начинается выдумка.

Как это вообще увидели: история открытия ризофагии

Подробное описание цикла ризофагии дали американские исследователи James F. White, Kenneth L. Kingsley, Sanjay K. Verma и Kevin P. Kowalski из Университета Ратгерса в 2018 году. Их ключевая работа:

«Rhizophagy Cycle: An Oxidative Process in Plants for Nutrient Extraction from Symbiotic Microbes», журнал Microorganisms, том 6, №3, статья 95 (2018).

Важно: это не теория «с дивана». Они использовали световую, флуоресцентную и электронную микроскопию и буквально сфотографировали все стадии - от входа микробов в корень до выхода обратно.

Дальше гипотезу проверили на других видах растений и других микробах. Qiuwei Zhang, Kenneth L. Kingsley и James F. White повторили и расширили исследования в работе:

«Endophytic Pseudomonas sp. from Agave palmeri Participate in the Rhizophagy Cycle and Act as Biostimulants in Crop Plants», журнал Biology, том 11, №12, статья 1790 (2022).

Там подключили конфокальную микроскопию и пометили бактерии флуоресцентными белками - теми самыми «светящимися» белками, которые впервые нашли у медуз. Это позволило отследить путь отдельных бактерий: снаружи корня → внутрь → обратно наружу, с изменением формы по пути.

Критический момент: это не догадки. Это реальные фото и видео, где видно, что именно происходит в корневых клетках.

Шесть этапов цикла ризофагии: что реально доказано наукой

Разберём цикл по шагам - только то, что подтверждено микроскопией и экспериментами.

Этап 1. Приманка: корневые экссудаты

Молодые участки корня, особенно кончики и зона роста, выделяют в почву корневые экссудаты - смесь простых сахаров (глюкоза, фруктоза), аминокислот, органических кислот (лимонной, яблочной и др.) и других соединений.

Это не отходы, а целенаправленная приманка. Разные виды растений выделяют разные коктейли экссудатов - и к каждому «столу» подтягиваются свои микробные сообщества.

Этап 2. Микробы осваивают поверхность корня

Приманенные экссудатами микробы начинают колонизировать поверхность корня - тончайшую плёнку, которую называют ризопланой. Они питаются выделениями корня, размножаются, образуют слизистый слой; один корневой волосок может быть покрыт миллионами бактериальных клеток.

Этап 3. Проникновение внутрь корневых клеток

Дальше часть микробов заходит уже не просто «на корень», а внутрь живых клеток в самой молодой зоне корня - меристеме. Они оказываются в периплазматическом пространстве - щели между жёсткой клеточной стенкой и плазматической мембраной.

Под микроскопом хорошо видно: внутри клеток корня присутствуют бактериальные клетки.

Этап 4. Окислительный удар: разрушение стенки микроба

Попав внутрь, микробы получают удар. Мембрана корневой клетки начинает выбрасывать активные формы кислорода (АФК) - в первую очередь супероксид (O₂⁻), агрессивную, высокореактивную молекулу.

АФК - это химическое оружие растения, классический инструмент защиты от патогенов. Эти молекулы атакуют клеточную стенку микроба (панцирь из пептидогликана), пробивая в ней дыры.

Под действием АФК бактерии теряют жёсткую стенку и переходят в L-формы - бесстеночные варианты, ограниченные только мембраной. У дрожжей наблюдается похожий результат: они превращаются в мелкие округлые образования без нормальной стенки.

Наглядное сравнение: Представьте спортивный мяч с верху которого кожаный чехол. Он нужен для защиты мяча от ударов и других внешних воздействий. Внутри - камера из резины. Она не дает выходить из мяча воздуху.

Вот по типу мяча построена и микробная клетка. Кожаный чехол - это клеточная стенка. Резиновая камера - это клеточная мембрана. Но вместо воздуха внутри клетки множество разных веществ. Клетка с мембраной, но без клеточной стенки называется протопластом.

Этап 5. «Выжимание» питания из микробов

После разрушения стенки мембрана микробной клетки становится проницаемой. Внутри у микроба:

  • ДНК (источник азота)
  • белки (азот, углерод, сера)
  • липиды (углерод, водород)
  • минеральные соли (фосфор, калий, магний)
  • растворимые органические молекулы (сахара, аминокислоты)

Через повреждённую мембрану всё это начинает «утекать» наружу. Часть микробов разрушается полностью, и содержимое клетки становится доступным для корневой клетки.

Так растение реально получает азот, фосфор, углерод и другие элементы из разрушенных микробов.

Честное признание учёных: White и коллеги прямо пишут, что доля питания, которая поступает через ризофагию, пока количественно не определена - масштаб вклада остаётся неизвестным.

Этап 6. Выход выживших - с потерями

Часть микробов выдерживает окислительный стресс - за счёт своих ферментов защиты (супероксиддисмутаза, каталаза и др.). В работах White et al. (2018) и Zhang et al. (2022) показано:

  • микробы переходят в L-формы (теряют стенку)
  • потом восстанавливают клеточную стенку и возвращаются к нормальной форме
  • выходят наружу через кончики растущих корневых волосков, снова попадая в ризосферу

White et al. логически предполагают, что при атаке АФК из микробов «вероятно» происходит утечка электролитов - ионов калия, кальция, магния и других.

Выжившие микробы выходят уже «потрёпанными»: они пережили окислительный стресс, были бесстеночными и, вероятно, потеряли часть внутренних запасов. В почве они отъедаются на органике и растворённых питательных веществах, пополняют запасы и либо снова заходят в корень, либо живут как обычные почвенные микробы.

Итак, каждый цикл ризофагии:

  • гарантированно даёт растению питание из полностью разрушенных микробов и клеточных стенок выживших микроорганизмов (доказано)
  • вероятно даёт дополнительные элементы из ионов, вытекающих из выживших микробов (логично, но количественно не подтверждено)

Как растение «отбирает» своих микробов: химический диалог

Механика понятна. Теперь вопрос: почему у одного растения одни микробы, а у другого - другие?

Химический язык корней - меню для микробов

Ответ - в химии корневых экссудатов.

  • Разные виды растений выделяют разный набор сахаров, аминокислот, органических кислот
  • Одно и то же растение меняет состав экссудатов с возрастом, сезоном, уровнем стресса и дефицитом элементов
  • Эти смеси работают как меню и как радиомаяк для конкретных групп микробов

Например:

  • при дефиците азота растение усиливает выделение тех соединений, которые особенно привлекательны для азотфиксирующих бактерий
  • при дефиците фосфора - тех, на которые лучше реагируют фосфатмобилизирующие микробы

Это не «сознательное решение», а результат эволюции: за миллионы лет сохранились такие варианты растений, чьи экссудаты эффективнее привлекали полезных микробов.

Обратная связь от микробов

Микробы тоже не молчат. Они выделяют свои сигнальные молекулы, которые:

  • стимулируют рост корневых волосков (увеличивая площадь контакта)
  • влияют на уровень выброса АФК растением
  • могут ускорять или замедлять ризофагию

В итоге получается двусторонний отбор:

  • растение отбирает тех, кто выдерживает его условия (АФК, состав экссудатов) и приносит пользу
  • неустойчивые или вредные микробы вылетают из системы
  • устойчивые и/или полезные закрепляются как часть специфического микробного сообщества вокруг корня

На уровне почвы это видно так: у каждого растения вокруг корней формируется свой микробный «пузырь» - сообщество, заметно отличающееся от фона почвы.

Где заканчивается наука и начинается блогер: разоблачение мифов о ризофагии

До этого момента мы говорили только о том, что есть в рецензируемых работах, с фотографиями и методами. Но в русскоязычном интернете появилась своя «легенда о ризофагии», продвигаемая одним из блогеров. Назовём его «блогер К».

Он опирается на тему ризофагии, но довыдумывает к ней механизмы, которых в научной литературе просто нет.

При этом какое-то время назад он транслировал одну версию. Теперь другую. Разберём их по очереди.

Версия 1 блогера К: растение «конструирует микробов» из нуклеотидов

Что он утверждает

Схема примерно такая:

  • микробы попадают в растение
  • растение разрушает их ДНК до отдельных нуклеотидов (составляющих ДНК)
  • нуклеотиды хранятся «в запасе»
  • когда растению нужны, например, азотфиксаторы, оно якобы собирает новую ДНК из этих нуклеотидов
  • так создаётся новый вид микроба с нужными свойствами, который выходит в почву, добывает элемент и возвращает его растению

Звучит эффектно. И совершенно не совпадает ни с биохимией, ни с данными по ризофагии.

Почему это не работает

На уровне источников. В работах по ризофагии действительно показано разрушение микробов и использование их компонентов растением. Но:

  • нигде не описано, что растение собирает новую ДНК из отдельных нуклеотидов
  • нигде не показано, что оно конструирует новых микробов
  • нигде не утверждается, что растение способно «по заказу» сделать азотфиксаторов и т.п.

На уровне биологии. Создание живого микроорганизма - это не «собрать конструктор из кубиков Лего».

Даже минимальная бактериальная клетка содержит:

  • полный геном (сотни-тысячи генов)
  • тысячи белков
  • рибосомы
  • сложную мембрану со специфическими белками
  • клеточную стенку
  • системы синтеза АТФ, репликации ДНК, деления, защиты от стресса

Растение просто не имеет внутри себя ни инфраструктуры, ни ферментов, ни точного «чертежа» для такой сборки. Корневая клетка - это не биореактор по синтезу новых видов микробов.

Версия 2 блогера К: «сборка микробов» из аминокислот и жирных кислот

Что он говорит во второй версии

Обновлённая схема:

  • микробы разбираются не на нуклеотиды, а на аминокислоты и жирные кислоты
  • эти молекулы «ведут себя в растении точно так же, как живые микробы»
  • в корневой шейке к ним «добавляются» фосфор, калий, магний и другие элементы
  • получается новый живой микроб, который выходит в почву и работает на растение

С логикой стало чуть лучше (он признаёт разрушение до молекул), но биологически это всё равно не выдерживает критики.

Где ошибка - основная проблема версии 2

Аминокислота и жирная кислота - это не живые существа. И добавление к ним минералов жизнь не создаёт.

  • Аминокислота - это маленькая органическая молекула, а не клетка
  • Живой микроб - это огромный, организованный комплекс с геномом, рибосомами, мембраной, стенкой, метаболизмом

Сложить в одну кучку аминокислоты, жирные кислоты, фосфор и магний - это не «собрать микроб». Это как свалить мясо, жир и кости и называть это коровой. Жизнь - это не набор, а организация.

Растительная клетка умеет:

  • использовать аминокислоты и жирные кислоты как питание
  • синтезировать свои собственные белки по своим генам
  • строить свои структуры

Но она не умеет:

  • собирать бактериальные геномы
  • создавать бактериальные стенки (другая химия)
  • собирать мембраны и органеллы бактерии
  • запускать в это всё полноценный микробный метаболизм

В реальных экспериментах White и коллег микробы после цикла ризофагии - это те же виды, что и до него. Они не «пересобираются» в новые существа, они либо погибают и служат кормом, либо выживают и возвращаются в почву.

Что на самом деле показывает наука о ризофагии

Суммируем реальную картину:

Ризофагия - это механизм, при котором растение:

  • привлекает определённые микробы экссудатами
  • вводит часть из них внутрь молодых корневых клеток
  • частично разрушает их с помощью АФК
  • извлекает питательные вещества из погибших и частично повреждённых клеток
  • выпускает выживших обратно в ризосферу через корневые волоски

Это подтверждено микроскопией, показано на разных видах растений и микробов.

Ризофагия НЕ является механизмом, через который растение:

  • конструирует новые виды микробов
  • синтезирует ДНК «по заказу»
  • создаёт живые организмы из разрозненных молекул
  • программирует микробов с нуля

Это просто один из путей получения питания - важный и интересный, но один из многих.

Зачем вообще об этом говорить: наука vs красивые сказки

Почему вообще стоит разбирать ошибки блогера К так подробно?

Потому что на его примере видно, насколько легко от реальной биологии скатиться к псевдонаучным сказкам, если не открывать первоисточники.

Цепочка обычно такая:

  1. Учёный (White) публикует аккуратную работу: «Мы видели, что микробы входят в корень, частично разрушаются, часть выживает». Честно пишет, что роль в питании пока количественно не ясна.
  2. Популяризатор читает и делает яркий заголовок: «Растения едят микробов!».
  3. Блогер К читает уже эту популяризацию, не лезет в оригинал - и достраивает свою картину: «Раз едят, значит, разбирают и собирают кого хотят».
  4. Дальше это разносится по соцсетям, обрастает ещё более смелыми интерпретациями, от науки остаётся только модное слово «ризофагия».

Простое правило: если что-то звучит слишком революционно, а ссылок на конкретные рецензируемые статьи нет - повод насторожиться.

Работы White et al. (2018) и Zhang et al. (2022) лежат в открытом доступе. Любой может за 10 минут найти их через Google Scholar или PubMed, посмотреть реальные снимки и прочитать, что там написано, а чего там нет.

Блогер К на эти работы не ссылается. И это уже сигнал: его версия не выдерживает сравнения с первоисточником.

Финал: что полезно вынести садоводу

Когда в следующий раз прочитаешь в интернете «сенсацию» про ризофагию (или любой другой механизм), задавай два вопроса:

  1. Есть ли ссылка на конкретную научную статью?
  2. Совпадает ли пересказ с тем, что в этой статье действительно написано?

Наука скучнее, чем истории блогеров, но у неё одно преимущество: она работает в реальной почве и на реальных растениях. А это в итоге важнее любых красивых легенд - и для урожая, и для понимания, что ты делаешь со своей землёй. 🌱

Основные научные источники

  1. White, J.F., Kingsley, K.L., Verma, S.K., Kowalski, K.P. (2018). «Rhizophagy Cycle: An Oxidative Process in Plants for Nutrient Extraction from Symbiotic Microbes.» Microorganisms, 6(3), 95. DOI: 10.3390/microorganisms6030095
  2. Zhang, Q., Kingsley, K.L., White, J.F. (2022). «Endophytic Pseudomonas sp. from Agave palmeri Participate in the Rhizophagy Cycle and Act as Biostimulants in Crop Plants.» Biology, 11(12), 1790. DOI: 10.3390/biology11121790

К сожалению блогер К - не единственный кто отталкиваясь от факта существования цикла ризофагии сочиняет небылицы. В следующей статье поговорим о сказках другого блогера. О том что доказано в этом процессе, что пока что гипотеза и что реально дает ризофагия для питания растений в вашем конкретном саду и огороде.