В направлении ИИ в Longevity происходит много интересного.
1) Так, продолжается работа над ESM-3, это модель для предсказания структуры и функции белков по их аминокислотной последовательности, или наоборот - синтеза последовательности под заданную функцию. В данном случае модель использовалась для того, чтобы синтезировать новые версии люминесцентных белков, которые не существовали бы в природе, и это удалось. Такого рода модели могут быть использованы в будущем для синтеза совершенно новых белков, останавливающих процессы старения. Сама модель и проект являются частично опенсоурсными, но согласно пояснению разработчиков, открытая версия урезана, с целью сделать невозможным синтез с ее помощью вирусов и токсинов.
Это правильно. Нечего синтезировать вирусы, надо синтезировать новые генные каскады, останавливающие старение.
2) Исследователи из Университета Торонто опубликовали еще одну модель - PepFlow - для предсказания функции и пространственной формы пептидов (более коротких, чем белки, аминокислотных последовательностей). В новостях, включая оригинал, почему-то пишут, что модель обойдет в этом отношении AlphaFold, но на мой взгляд, это просто разные модели. Пептиды более интересны фармацевтическим компаниям, потому что их проще синтезировать, дозировать и продавать в виде препаратов, а также иммунная система обычно не реагирует на них, так что они более безопасны.
Белки больше интересны для целей генной терапии и для исследований, потому что они могут иметь больше функций, могут встраиваться в сложные структуры клетки (а не только исполняют сигнальные роли, как пептиды) и могут быть более долгоживущими.
Так или иначе, в гонку по разработке новых инструментов синтетической биологии включается все больше игроков, и это не может не радовать, потому что инвесторов тоже становится больше и это направление многие видят как приоритетное в борьбе со старением. Об этом вы можете прочитать не только на нашем канале, но и в интервью Майкла Антонова (ex-основателя Oculus), который после сделки на 2 млрд. долларов по продаже своего VR-стартапа, вложился в создание компании Deep Origin, занимающейся синтезом белков и in silico исследованиями новых лекарств.
