# biodata на связи

Прогулялись по Бишкеку и окрестностям с Димой Веремеенко, основателем проекта Nestarenie, ветераном движения по борьбе со старением. В 20х числах апреля Дима проводит Nestarenie Camp в Самарканде (Узбекистан). Мероприятия Nestarenie это всегда собрание единомышленников и тонны полезной информации, так что проверьте свои планы на конец апреля, вдруг получится совместить высокий сезон в Центральной Азии с полезной конференцией. #biodata на связи

А у нас небольшое объявление: Выступаю в Бишкеке. 📚 Приглашаем на новую встречу ololo BOOK CLUB, которую мы организуем совместно с магазином Janmates! 📚 В этот раз в этот раз обсудим две знаковые книги в области биогеронтологии: «Ending Aging» Обри ди Грея и «Replacing Aging» Жана Эбера. 💡 Как наука и биотехнологии могут повлиять на борьбу со старением? Какие подходы и теории изложены в этих книгах? На встрече мы поговорим о технических методах борьбы с возрастными изменениями, научной обоснованности этих подходов и их связи с реальными достижениями в биотехнологиях. Эта дискуссия откроет вам перспективы в области продления жизни и роли науки в будущем. Если вам интересны стратегии борьбы со старением, не пропустите! 🌟 ololo BOOK CLUB проходит при поддержке книжного магазина Janmates. На встречах вас ждут приятные подарки, а также скидка 10% на книги и другие товары магазина по промокоду «ololo». 🌟 📅 Дата: 13 марта, четверг 🕕 Время: 18:30 📍 Место: ololoPlanet, (Бишкек, ул. Юнусалиева, 80) 🎟 Вход свободный при регистрации ✍️Telegram ololoCommunity

🌸 Всех девушек 8 марта! 🌸 Вы — источник вдохновения, силы и тепла. Спасибо за ваши идеи, поддержку и тот свет, который вы приносите в этот мир. Пусть этот день будет тёплым, радостным и наполненным только хорошими моментами! ❤️

Сидели с Иваном Моргуновым и обсуждали кейс Дейва Паско (Dave Pascoe) американского биохакера 62 лет. Мы не покупаем фотки обмазанного маслом Дейва из бани, поэтому разбирались основательно, и не во всем мы поддержали Дейва, но любом случае он попадает в наш watch-list и будем отслеживать его успехи. У нас остались вопросы, и в любом случае, чего за глаза кости промывать) Отправил приглашение, зададим ему наши вопросы, если придет к нам на стрим. #biodata на связи

Для всех, у кого сегодняшние новости вызывают фрустрацию, предлагаем простое решение. Новое исследование, опубликованное в журнале Microbiom (n = 32 427 участников), показывает, что употребление хотя бы одного апельсина в день снижает риск депрессии. Поиски механизма показали, что употребление цитрусовых вызывает рост 15 видов бактерий, но в их числе и резидентного штамма бактерий Faecalibacterium prausnitzii. Также показана, связь более низкой численности вида F. prausnitzii и его метаболитов-кофакторов S-аденозил-L-метионин (SAM) цикла у участников с депрессией. Причинно-следственная связь, судя по всему, в том что более низкая продукция SAM этими бактериями F. prausnitzii может снизить экспрессию гена кишечной моноаминоксидазы A, в свою очередь участвующего в синтезе серотонина и дофамина. Короче, всем по апельсинке в день и хорошее настроение вернется (depression relative risk = 0.78). #biodata на связи

И вот пока разбирался, прочитал, что в эти же дни произошел релиз модели EVO-2 (о возможностях первой версии, которая вышла в начале 2024 года вы можете почитать тут). Это семейство моделей в отличие от AlphaFold и BioEmu предназначено для более низкоуровневой задачи: проектирование последовательности нуклеотидов ДНК, с которых может быть в том числе считан нужный вам белок. Натренированная на последовательностях ДНК из более чем 9 трлн. нуклеотидов (это ДНК более 128 000 видов, вошедших в датасет для обучения) EVO-2 способна проектировать целые геномы с промоутерами, интронами и прочими элементами. Этот релиз принципиально замыкает весь спектр задач по моделированию новых дизайнерских (полностью синтетических, не существовавших в природе) генов, которые в том числе могут применяться для достижения пренебрежимой скорости старения. Тем не менее, с учетом скорости проведения "мокрых" экспериментов, до получения годного результата на человеке остаются десятилетия. В процессе поиска обсудил это с Grok 3 Deep Research, у которого тоже периодически кипел мозг. #biodata на связи

Тут важное событие: Microsoft присоединилась к гонке по вычислению протеинов, опубликовав в открытом доступе свою модель Biomolecular Emulator-1 (BioEmu-1). И сразу залидировала в гонке, если правильно понимаю, решив важнейшую задачу моделирования динамического поведения белков. Как раньше отмечалось, уже известная нам модель AlphaFold версий 1-2-3 решает задачу воссоздания наиболее вероятной статической структуры белка по его аминокислотной последовательности. Однако в ходе модификаций в течение своего жизненного цикла белок неоднократно меняет форму и следовательно, функцию. Этот аспект посттрансляционных модификаций упущен в моделировании AlphaFold, а точнее, правильно сказать, не входит в ее задачи. И вот именно поиск этого многообразия форм решен BioEmu-1. Как описано в публикации, для решения этой задачи BioEmu-1 обучили на трех наборах данных, каждый из которых придал конечной модели отдельные важные свойства, а уже их синергия обеспечила решение: (1) База данных AlphaFold (AFDB) (обеспечивает выделение диапазона возможных структур); (2) набора данных моделирования молекулярной динамики (это данные о динамических модификациях белков, полученные как прямым наблюдением в микроскопах, так и описания физико-математическими моделями); этот датасет позволил предсказывать физически правдоподобные структурные изменения, отображая множество возможных структур, которые может принять один белок; (3) экспериментального набора данных стабильности сворачивания белка (позволяет выбирать свернутые и развернутые структуры с правильными вероятностями). Оказывается, принципиальный препринт этого результата вышел еще в декабре, но я его проглядел. Да и эту ссылку мне прислал подписчик. Спасибо ему) Надо продолжать читать обзоры по этой публикации и вникать дальше, но еще раз, если правильно понимаю, то решена именно та проблема, за которую скептики ругали AlphaFold. Заметили косяк в моем изложении? Отпишитесь в комментах, давайте обсудим) #biodata на связи

Всем спасибо за участие! к сожалению запись видео пока не появилась, и это может означать, что имел место сбой записи, т.к. обычно tldv предоставляет запись в течение 10 минут после окончания встречи. Ну штош, это издержки прямого эфира. UPD: Благодаря помощи более опытных товарищей (спасибо Олег!) видео мы спасли и выложили: 1) В нашем ВК-сообществе. 2) В tldv.io (с таймкодом, который пока обрабатывается). Также оставляю тут слайды, которые не содержат ответов на вопросы, но возможно будут полезны тем, кто был на встрече. Напишите в комментариях, что было бы хорошо улучшить в формате (кроме того что запись должна работать 🤪). Следующий стрим проведем примерно через месяц, сделаем доклад (тему выберем, но например можно про измерение биовозраста и есть ли в нем какой-то смысл), и снова возьмем все вопросы, у кого они будут. И так далее пойдем по всем актуальным темам биохакинга.

Итак, поскольку большинству удобно 23.02 14:00 МСК мы проведем наш первый стрим про биохакинг в это время. В повестке небольшое интро и ввод в тему от меня и дальше ваши вопросы. В этот раз используем Google meets, запись будет от tldv.io Cтримим про биохакинг - Ep 01 Sunday 23 Feb · 14:00 – 15:00 MSK Google Meet joining info: https://meet.google.com/hvi-jmoh-ryt

Благодаря прекрасной Елене Сухановой мы оперативно располагаем записью моего доклада "Откуда придет победа над старением?" для конференции Древо Жизни, и можем им поделиться вместе со слайдами. #biodata на связи

📅 15–16 февраля в Москве пройдет конференция "Древо жизни" Учёные и предприниматели соберутся, чтобы ответить на главные вопросы: 🔬 Где сейчас наука в понимании механизмов старения? 🚀 Можем ли мы повлиять на его замедление и обращение? 🏛 Что должны делать государство, бизнес и общество, чтобы ускорить прогресс? 🔹 Что в программе: ✅ Панельные дискуссии с лидерами биотеха, нейронаук, генетики и клеточной медицины. ✅ Практические мастер-классы. ✅ Презентации передовых разработок и технологий. ✅ Нетворкинг с игроками индустрии. Мой доклад состоится утром 16.02. 🎟 Промокод LONGEVITY20 даёт -20% на билет! 📍 Программа и регистрация: treeoflife-conf.ru #biodata на связи

Связь людей - истинная сила. А связи формируются в том числе на мероприятиях, и поэтому ловите список крупных мероприятий в отрасли Longevity 2025 года по всему миру, который мы курируем для нашего сообщества предпринимателей. Если вы захотите добавить известные вам мероприятия, оставьте комментарий к посту, или напишите мне в тг на @biodata. Что за сообщество: летом 2024 года совместно с еще 4 предпринимателями я основал сообщество предпринимателей за радикальное продление жизни. Рабочее название LessDead, мы находимся в полу-stealth режиме и набираем участников. Что делаем полезного: объединяем предпринимателей в направлении Longevity, потому что победа в конечном итоге придет не от государства, не от ученых, и не от инопланетян, а от прорывных инженерных проектов, подобных 23me, Altos Labs, компаний из портфеля Apollo Health или OS Fund, и подобных им стартапов. Денег не даем) но можем помочь сориентироваться в ландшафте технологий и найти нужные контакты. Участие в сообществе бесплатное, но есть правила) 1) Вы должны быть предпринимателем в области longevity или искать вход в эту отрасль. 2) Вы должны поддерживать идею радикального продления жизни (цель — превышение текущего максимума в 120 лет). 3) Псевдонаука и ложные заявления не допускаются. Сложные случаи должны быть подтверждены публикациями или разбираются экспертным советом. 4) Принимаются только продукт-ориентированные предприниматели (например, допускаются IT, wet-biotech, deep tech и т.д., а инфобизнес и консалтинговые модели не принимаются). 5) Недобросовестная конкуренция (разглашение конфиденциальной информации, инсайдерская торговля, взятки и т.д.) запрещена. По всем вопросам: в тг на @biodata #biodata на связи