Якопо Амигони родился, предположительно, в Венеции в 1675 году.
Однако, художник в конце жизни заявлял, что он родился в Неаполе в 1682 году.
Его имя появляется в списках Fraglia dei Pittori (гильдия живописцев) в Венеции в 1711 году.
Он был учеником Антонио Беллуччи (1654-1726).
С 1717 по 1728 год художник работал в Баварии, в Шлейсхайме, Нимфенбурге и Оттобойрене, в основном создавая фрески.
С 1729 по 1739 год Якопо Амигони находился в Англии.
Там он стал важным портретистом, получив множество королевских заказов, хотя и продолжал работать как исторический художник в Moor Park и в других местах.
Между 1739 и 1747 годами он вернулся в Венецию; наиболее заметными зарегистрированными работами этого времени являются алтарные образы.
Последние пять лет он провел в Испании, где продолжал работать как портретист и декоратор для испанского двора.
Умер художник в 1752 году.