Будет интересен, как и исследователям, ученым так и людям , которые ищут просвещения и саморазвития. Англо-русский словарь прочтений ДНК, я публиковала здесь.
Микробиота
Сообщество микроорганизмов, включая бактерии, археи, грибы, вирусы и другие одноклеточные организмы - простейшие, которые населяют определенную среду обитания (земля, озеро, банка с квашенной капустой, организм хозяина, рот, и т. д.).
Метагеном
Вся коллекция геномов (полный набор генетического материала) членов микробиоты. Эта коллекция получается путем дробного прочтения ДНК, выделенной из образца (слюны, отходов кишечника, мазка и т. д.), с последующей сборкой или сопоставлением с эталонной базой данных и описания генов. Из прочитанного генома можно получить информацию о потенциальной функции микробиоты.
Метатаксономика
Метатаксономика стремится расположить все полученные последовательности ДНК из метагенома для создания метатаксономического дерева жизни, которое показывает взаимосвязи между всеми обитателями микробиома.
Микробиом
Микробиом состоит из среды обитания, условий окружающие среды, микробиоты и метагенома. Например, миркобиом кишечника — это сам кишечник, все микробы в нем, их гены, ферменты выделяемые нашими организмом в кишечник для переваривания пищи, уровень кислотности, отсутствие кислорода и т. д.
Метаболизм
Совокупность биохимических процессов, которые происходят в живых организмах для поддержания жизни. Это создание и распад новых молекул, необходимых для выполнения клеточной работы, получения энергии и т.д. У каждого божьего создания свой метаболизм.
Метаболомика
Изучение всех молекул, произведенных во время метаболизма. Можно изучать молекулы, произведенные одним живым организмом, или же всех организмом живущих в одном месте, и т. д.. Полученный в результате переписи всех метаболитов набор называется метаболомом. Для изучения метаболома используют в том числе спектроскопию ядерного магнитного резонанса, масс-спектрометрию, различные виды хроматографии, и т. д.. Я, например изучаю метаболом всех обитателей кишечника.
Метатранскриптомика
Вся информация о работе клеток зашифрована в ДНК. Клетки переводят/расшифровывают ДНК на понятный для простого рабочего люда (рибосом) язык РНК. На язык РНК расшифровывается лишь малая толика ДНК. Рибосомы создают из РНК белки, которые могут работать, например как ферменты. Метатранскриптомика изучает набор этих выражаемых клеткой РНК (мета-РНК). Изучая только лишь эти РНК, можно получить информацию об управлении, узорах активности генов и жизнедеятельности организмов. Можно изучать метатранскриптомику одного микроба, или же всей микробиоты в одном кишечнике. Для изучения мета-РНК ее переводят обратно в ДНК, с помощью фермента, взятого из ретровируса. Ретровирусы единственные на планете, кто умеет так делать. ВИЧ один из представителей ретровирусов.
Метапротеомика
Раз есть отрасль изучающая всю ДНК, РНК, из сообщества или индивида, то естественно есть и отрасль изучающая все белки, производимые индивидом или микробным сообществом, в определенный момент времени. Вычислительный анализ позволяет отнести эти белки к их биологическому происхождению - тому или иному микроорганизму. Для определения что за белок, часто используется жидкостно-хроматографическое разделение, соединенное с масс-спектрометрией.
А как же микрофлора?
Микробиологи уже давно стараются не использовать это неправильное определение, хотя слово "микрофлора" все еще можно найти в научной и медицинской литературе. Определение слова "флоры" датируется серединой 1600-х годов и берет свое начало от латинского имени "Флора", римской богини цветов, и латинского слова "flor", означающего цветок. Микрофлора — это микроскопические растения, или же растения микросреды обитания. Среди микробов нет видов, которые принадлежали бы к царству растений. Эти определения и их происхождение делают очевидным, что "микрофлора" относится к растениям, а не к микробам, и по отношению к микробам использование "микрофлоры" неуместно и противонаучно.
Источник:
Marchesi, J. R., and J. Ravel. "The vocabulary of microbiome research: a proposal. Microbiome. 2015; 3: 31."
Ставя любо и подписываясь, Вы помогаете мне продвигать настоящую науку.
Предыдущая статья: Расцветали яблони и груши