Есть мнение, – его, кстати, разделяют все лица, сведущие в предмете, – что «вирусы» – искусственная, заведомо не связанная общим происхождением группа, состоящая, как минимум, из 11 таксонов. Объединённых лишь специфической формой паразитического образа жизни. Хотя, «жизни» ли, – тоже хороший, правильный вопрос. Тем не менее, даже на фоне прочих вирусов выделяются вирусы гигантские. От остальных представителей группы они как-то особенно далеки.
Среди прочих связанных с гигантскими вирусами мнений есть и такое, что их следует считать четвёртым, – кроме бактерий, архей и эукариотов, – доменом живого мира. Причём, только их. Остальные вирусы не домен, а пока непонятно что. Но это мнение не бесспорно. Официальным пока диагнозом является признание гигантских вирусов «сущностью окончательно классифицированной». То есть, гигантский вирус, это гигантский вирус. Его нельзя спутать с чем-либо другим, и он не может быть включен в какую-либо более широкую общность. Даже в общность «живого». Ведь отнесение к «живому» вирусов остаётся темой дискуссионной.
...Собственно же гигантский вирус… ну… во-первых, велик. Больше, чем обычно бывают бактерии и археи, – до 600 нм. Очень велик и его геном, – до 1.5 миллионов пар. Что, опять-таки, больше, чем у бактерий бывает обычно. Хотя среди прокариотов есть и исключения, – до 10 миллионов пар… Для вирусов же, однако, характерны крошечные геномы, исчисляемые тысячами пар. Это логично. Зачем тратить фосфор, если не требуется кодировать производство разнообразных белков. Их достаточно столько, чтобы было из чего капсид сделать. РНК-вирусы не кодируют даже сами себя, а лишь вносят «помехи» в работу ДНК хозяина, так что она начинает плодить вирусы…
В этом заключается главное отличие гигантских вирусов от прочих. Их огромная ДНК лишь ограниченно использует (или вообще не использует, понять очень сложно) возможности ДНК хозяина. Но и до «собственноручного» синтеза белков не опускается. Как принято у молекул такого ранга, она использует обслуживающих её «рабочих» – молекулы РНК. Но, главным образом, хозяйских. Собственных рибосом (рРНК) у паразита нет. Но работы ведутся с использованием материалов, подносимых транспортной РНК (тРНК)… вируса. То есть, доставляют вирусной «матке» материалы для репликации «родные» рабочие.
Соответственно, гигантский вирус, вторгнувшись в клетку, работает, как «альтернативное ядро». Его ДНК не дрейфует в цитоплазме, внося хаос в работу клетки, а окружает себя мембраной. Мембрана может быть собственной, – либо же вирус использует материал мембраны хозяина. В некоторых же случаях гигантский вирус сразу атакует ядро клетки. Проникнув внутрь, его ДНК демонтирует ДНК хозяина, а ядерную мембрану затем использует по назначению… Что, кстати, напоминает гнездовой паразитизм встречающийся у муравьёв. Некоторые виды не имеют собственной рабочей касты, а муравейник захватывают.
...Вне клетки гигантский вирус, подобно обычному, представляет собой молекулу ДНК, окружённую белковым капсидом про структуру которого определённо можно сказать только то, что она более сложна, чем для вирусов свойственно. Назначение отдельных её элементов пока непонятно. Остаётся неизвестным, даже выполняют ли они вообще какие-то задачи. Особенности строения капсида могут быть и рудиментами… однако, в таком случае это рудименты неизвестно чего.
Относительно же происхождения гигантских вирусов известно, что – как минимум, в актуальном виде, – они не могут быть старше эукариотов. Потому что, в бактериях не поместятся. И по общему впечатлению даже сложнее них. Причём, явное сходство «вирусной фабрики» гигантского вируса и клеточного ядра легло в основу интересной гипотезы, что ядро клетки это, именно, гигантский вирус, когда-то внедрившийся в архею, уже интегрировавшую в себя бактерии.
Гипотеза эта действительно интересна и хорошо объясняет происхождение клеточного ядра. Но как и прочие связанные с вирусами гипотезы – никуда не годится. Во-первых, если ядро, это бывший гигантский вирус, слившийся с аналогичным образом впитавшей бактерий археей благодаря горизонтальному переносу генов… То откуда тогда взялся сам вирус-гигант?
Во-вторых, именно гигантские вирусы являются рекордсменами по «чуждости». Более 30% их генов не встречаются ни у кого больше. Что, кстати, и понятно, ибо ядерная мембрана горизонтальному переносу генов препятствует.
Другое объяснение появления гигантских вирусов представляет их потомками эукариотов. То есть, это ядра без клетки, утраченной в результате паразитического упрощения. Данная версия также красиво объясняла бы всё, если бы не противоречила фактам. Начиная всё с того же обилия генов присущих только гигантским вирусам. Не всё гладко и просто со здравым смыслом. Если происхождение вирусов пусть безуспешно, но пытаются объяснить упрощением бактерий, перешедших к внутриклеточному паразитизму, – в этом есть логика. Как минимум, существуют (правда, не проявляя склонности к столь радикальному упрощению) бактерии ведущие такой образ жизни. Но в данном случае речь об эукариоте, – сложной клетке с ядром. Которую так-то просто внутрь другой клетки не втиснешь.
Хотя… природа предоставляет примеры. Внутри клеток могут паразитировать простейшие и даже одноклеточные грибы. Однако, это относительно редкое явление, и паразиты также не упрощаются сколько-то значительно. Так чтобы образовать переходные к гигантскому вирусу формы. И это, в свою очередь, объяснимо. Слишком упроститься паразиты просто не успевают, так как погибают вместе с видами хозяев, к существованию в организмах которых приспособились.
В природе все паразиты молоды эволюционно. Имеют близких свободноживущих родственников. Все, кроме вирусов. На вирусы, включая и гигантов, общий принцип, почему-то, не действует.
Бонусные статьи на Boosty и поддержка канала
Ещё одна гипотеза предполагает, что гигантские вирусы произошли от клеточного ядра, когда внезапно для себя, – в результате мутации – ядро из клетки «сбежало». Но это выглядит менее убедительно, чем представление о прочих вирусах (или некоторых из них), как о «молекулах-революционерах».
Наиболее убедительным представляется, именно, версия «четвёртого домена». Гигантские вирусы – упростившиеся древние, не родственные бактериями и археям, микроорганизмы. Их сходство с клеточным ядром, в таком случае, конвергентно. Объясняется лишь необходимостью решения одинаковых с клеточной ДНК задач. При таком подходе сложность гигантских вирусов можно трактовать как ту самую «избыточную», которой не достаёт вирусам прочим, чтобы признать упростившимися микроорганизмами и их.