Ученые пришли к выводу, что у людей со значительной вирусной нагрузкой показатели вирусной рекомбинации гораздо выше. Фактически чем больше ВИЧ в крови, тем легче вирусу эволюционировать. Работа опубликована в журнале Molecular Biology and Evolution.
Одна из причин, почему с ВИЧ так сложно бороться, — это высокая скорость рекомбинации вируса. Она обеспечивает обмен генетической информацией между штаммами и стимулирует эволюцию ВИЧ среди людей. Этот генетический обмен помогает вирусу уклоняться от иммунной системы и становиться устойчивым ко многим лекарствам.
Одним из важных, но недостаточно изученных этапов рекомбинации ВИЧ является коинфекция, при которой две разные вирусные частицы заражают одну и ту же клетку. Несмотря на многолетние исследования, у ученых еще нет понимания, может ли изменение скорости коинфекции привести к трансформации скорости рекомбинации. Хотя исследования ВИЧ на клеточных культурах и мышах показали, что рост коинфекции связан с увеличением количества рекомбинантных вирусов, неизвестно, обнаруживается ли этот эффект у людей, живущих с ВИЧ.
Ученые предположили, что люди с высокой вирусной нагрузкой будут иметь больше коинфицированных клеток, что приведет к повышенным показателям рекомбинации. Чтобы исследовать эту гипотезу, они разработали новый подход под названием «Анализ рекомбинации через распад связей временных рядов» (RATS-LD), позволяющий количественно оценить рекомбинацию с использованием генетических ассоциаций между мутациями.
Эксперты установили, что среди людей с наименьшей вирусной нагрузкой скорость рекомбинации стандартная относительно существующих оценок. Однако среди образцов с самой высокой вирусной нагрузкой медианная оценка примерно в шесть раз выше.Эти результаты показывают, что уровень рекомбинации ВИЧ может быть даже более высоким, чем предполагали исследователи ранее. Ученые также считают, что плотность населения может влиять на эффективную скорость рекомбинации в различных условиях.