С 21 по 25 августа сотрудники компании Диаэм активно участвовали в проведении V Научно-практической школы «Анализ отдельных клеток» в г. Томске.
Данная школа является продолжением ежегодных научно-практических школ «Секвенирование единичных клеток» (2019-2021 гг.) и «Анализ отдельных клеток» (2022 г.).
Программа мероприятия состояла из докладов специалистов из ведущих лабораторий, разработчиков технологий и поставщиков продукции. Но большая часть времени была посвящена практическим занятиям, которые включали лабораторные практикумы и практические занятия по биоинформатике.
Практические лабораторные практикумы проходили на базе НИИ онкологии и медицинской генетики Томского НИМЦ. Методы, представленные на практикумах, включали пробоподготовку, секвенирование единичных клеток и различные варианты цифровой ПЦР.
Предварительный этап подготовки образцов является особенно важным для любого последующего рабочего процесса и здесь очень критично использовать качественные реагенты и оборудование. Именно поэтому компания Диаэм предоставила надежные и проверенные продукты производства компании RWD (Китай) для лабораторного практикума: «Пробоподготовка образцов, в т.ч. механическая и ферментативная диссоциация, проточная цитометрия и сортировка клеток».
В задачи практикума входило получить клетки из разных источников, например из замороженных тканей или из парафиновых срезов. Для работы с парафиновыми срезами использовался автоматический ротационный микротом Minux S700A, RWD, который позволяет сделать качественные срезы на стекле даже начинающим пользователям и многие участники практикума смогли это сделать, сев за прибор в первый раз.
Немаловажным является процесс получения клеточной суспензии из замороженных тканей, поскольку очень важно при этом не повредить клетки. Использование клеточного диссоциатора DSC-400, RWD в комплекте с пробирками и наборами, оптимизированными для диссоциации различных тканей, позволяет выполнить эту процедуру в течение 15-30 минут и получить суспензии с высокой жизнеспособностью. Для последующей оценки жизнеспособности использовался счетчик клеток, C100, RWD, который оценивает жизнеспособность, по стандартному методу с трипановым синим, а также с помощью флуоресцентных красителей.
Технология магнитной сепарации вызвала большой интерес у участников школы, поскольку является удачным аналогом известных европейских брендов. Сепаратор клеток на магнитных частицах, RWD – это комплект со стендом, магнитом и колонками, с помощью которого можно быстро выделить клетки, используя наборы с определенными антителами и магнитными микрошариками.
Одним из интригующих моментов на школе было сравнение двух приборов: системы капиллярного электрофореза Qsep (BiOptic) и биоаналайзера (Agilent Technologies). Результаты, полученные на обоих приборах, оказались сопоставимыми. Это значит, что нет необходимости переплачивать за дорогой прибор, а с уверенностью можно использовать более доступный по цене прибор для капиллярного электрофореза Qsep (BiOptic). Кроме того, более доступны стали и расходные материалы – картриджи для Qsep, ассортимент которых Диаэм поддерживает на складе.