15 марта 1968 года был подписан приказ, по которому Арктический и Антарктический научно-исследовательский институт получил собственный научный флот. Институту от Главного управления гидрометеорологической службы передали научно-исследовательский суда «Профессор Визе», «Профессор Зубов», «Океанограф», экспедиционный состав и база материально-технического снабжения. Суда неоднократно участвовали в различных экспедициях, на борту размещались лаборатории и комплексы для запуска геофизических ракет. В настоящее время флот ААНИИ проходит масштабное обновление и важную роль в этом выполняет ОСК. В 2012 году корабелы ОСК Адмиралтейские верфи передали ААНИИ научно-экспедиционное судно «Академик Трешников», выполняющее научные работы в Антарктике. В 2022 году в состав флота института вошла ледостойкая самодвижущаяся платформа «Северный полюс», построенная по проекту 00903 конструкторского бюро ОСК «Вымпел» на заводе ОСК Адмиралтейские верфи. В 2023 году адмиралтейцы приступили к постройке нового