Онлайн платформы AMRmap и AMRcloud

Сегодня заведующий лабораторией антибиотикорезистентности НИИАХ, к.б.н. Михаил Владимирович Эйдельштейн расскажет про онлайн платформы AMRmap и AMRcloud для автоматизированной обработки данных, полученных в ходе многоцентрового мониторинга антибиотикорезистентности.

Источник данных для AMRmap (https://AMRmap.ru) – результаты исследований, проведённых в центральной лаборатории НИИАХ, куда клинические лаборатории-участники направляют выделенные бактериальные изоляты В центральной лаборатории изучают их чувствительность к широкому спектру антимикробных препаратов с помощью референтных фенотипических и молекулярно-генетических методов.

AMRmap содержит данные об антибиотикорезистентности более 45 000 клинических изолятов. Это даёт возможность:

— проводить анализ этиологической структуры возбудителей различных инфекций,

— устанавливать активность разных препаратов в отношении отдельных видов и групп микроорганизмов,

— определять распространенность наиболее важных генетических маркеров устойчивости,

— сравнивать генотипы и фенотипы резистентности.

В AMRmap имеется широкий набор инструментов для выборки и фильтрации данных и представления результатов в наглядном виде –
интерактивные диаграммы, графики, географические карты и таблицы.

Сегодня AMRmap – источник самой полной, максимально точной и методически выверенной информации. Однако у этой платформы все же имеется недостаток – данные обновляются с задержкой, так как загружаются 1-2 раза в год после завершения очередного этапа исследования.

Использование AMRcloud (https://AMRcloud.net) позволяет избежать этих ограничений. Платформа AMRcloud продолжает и развивает концепции AMRmap. Её особенности:

— Пользователи могут загружать, анализировать, делиться собственными данными по резистентности к антимикробным препаратам.

— Объём исследований – от локального эпидемиологического мониторинга в отдельном ЛПУ до больших международных проектов.

— Широкий выбор анализируемых параметров, например, различных клинико-эпидемиологических характеристик пациентов, факторов риска развития инфекций и т.д.

Возможность автоматической интерпретации индивидуальных количественных результатов оценки чувствительности на основании современных критериев (EUCAST, CLSI, и др.) по выбору пользователя, обобщения и сравнения данных по любым параметрам, формирования различных отчетов и веб-ссылок.

Пользователи могут обновлять существующие и загружать новые данные с любой периодичностью.

Простая процедура загрузки данных, быстрая обработка, возможность автоматизации позволяют проводить мониторинг в режиме реального времени.