По общепринятой версии, Нилюфер была византийской гречанкой, дочерью текфура Ярхисара. Некоторые исследователи называют именем Нилюфер, данным ей при рождении, Холофира (Оливера). Дата её рождения неизвестна.
По мнению Пирс, жёны Орхана, происходившие из знатных христианских семей, сохраняли свою веру и имена, а Нилюфер скорее всего была наложницей улубея, получившей имя в гареме — в переводе с персидского Нилюфер означает «водяная лилия».
Так же, по мнению Ашикпашазаде, тот факт, что сын Нилюфер, Мурад I, родился примерно в 1326 году, исключает вероятность того, что она была дочерью текфура Ярхисара, похищенной более двадцати пяти лет назад. Кроме того, брак с дочерью текфура не имел для Орхана или его отца политических перспектив.
Традиционно Нилюфер считается матерью двух сыновей Орхана I — Сулеймана-паши (ум. 1359) и будущего султана Мурада I (1326—1389). В отношении Мурада сомнений у историков не возникает, однако Сулейман, самый влиятельный сын Орхана при его жизни, мог быть сыном другой женщины — вероятно, Эфтандисе-хатун. Лесли Пирс обосновывает это тем, что Нилюфер впервые появляется в документах вакфа Орхана в 1324 году; Мурад же, по общепринятой версии, родился два года спустя, когда у Орхана уже было трое сыновей, включая Сулеймана, и все они были достаточно взрослыми, чтобы исполнять государственные дела. Таким образом, на момент рождения Сулеймана Нилюфер ещё не вошла в султанскую семью; более того, разница в возрасте Сулеймана и Мурада, составлявшая около двадцати лет, была слишком велика, чтобы они были полнородными братьями.
С 1331 года Нилюфер долгое время оставалась в Изнике. В 1359 году её сын стал правителем Османского бейлика, а затем и султаном Османской империи; сама Нилюфер получила титул, аналогичный появившемуся позднее титулу валиде-султан.
В Изнике в 1388 году по приказу Мурада I в память о его матери был построен имарет (благотворительная кухня), что говорит о том, что Нилюфер умерла не позднее начала 1380-х годов. Нилюфер умерла в Бурсе и была похоронена здесь же в гробнице мужа.
