Найти в Дзене
Елена Говорова

Математическое моделирование в биологии: философия и прагматика (Часть 1)

Оглавление

Введение

Философия может пролить свет на математическое моделирование и сопоставление моделирования и эмпирических данных.

В данной работе исследуются три философские традиции структуры научной теории — синтаксическая, семантическая и прагматическая, чтобы показать, что каждая из них освещает математическое моделирование. В "Прагматическом взгляде" определены четыре критические функции математического моделирования:

  • унификация как моделей, так и данных
  • подгонка модели под данные
  • учет идентификации механизма наблюдения
  • прогнозирование будущих наблюдений
https://unsplash.com/photos/OGZtQF8iC0g
https://unsplash.com/photos/OGZtQF8iC0g

Такие аспекты исследуются здесь с использованием недавнего обмена между двумя группами математических моделистов в области биологии растений. Научные дебаты могут возникать из различных философий моделирования.

Философия науки и моделирование

В ХХ веке последовательно развивались три различных философских взгляда на природу и динамику научной теории. Каждая из них была критикой предыдущей перспективы. Каждая из них освещает научное моделирование.


Синтаксический взгляд: Логическая структура научной теории

Синтаксический взгляд (за который выступает Венский кружок "Логические позитивисты") поставил под сомнение немецкий идеализм XIX века и утверждал, что научная теория на самом деле представляет собой набор предложений, выраженных на логическом языке L (например, Carnap). Язык L состоял из правил вывода (например, modus ponens) и логических терминов (например, ∃, ¬), а также двух типов словарей:

  • теоретический (например, "протон", "белок" или "пролетариат")
  • наблюдательный (например, "твердый", "жидкий" или "синий")

Приговоры могут быть двух форм — либо теоретической (т.е. содержащей только теоретический словарь, либо смешанной, т.е. правила соответствия), либо наблюдательной (т.е. не содержащей теоретического словаря и приобретающей смысл только из экспериментальных наблюдений).

Семантический взгляд: Математическая структура научной теории

В конце 1950-х - начале 1960-х годов некоторые философы науки критиковали синтаксический взгляд и сосредоточились на истории и социологии научной практики (например, Томас Кун, Пол Фейерабенд, Н.Р. Хансон). Другая группа предложила, чтобы философия науки была сосредоточена на математических моделях, а не на логических языках. Ван Фраассен, новаторский сторонник этого СЕМАНТИЧЕСКОГО МЕТОДА, заметил:

"Чтобы представить теорию, мы определяем класс ее моделей непосредственно, не обращая внимания на вопросы аксиоматизации, на любом специальном языке, каким бы уместным, простым или логически интересным он ни был. И если теория как таковая должна быть отождествлена с чем-либо вообще — если теории должны быть переосмыслены — то теория должна быть отождествлена с классом ее моделей"

(Van Fraassen, 1989)


Модели "всегда были математической структурой", а теория представляла собой семейство математических моделей.
Семантический взгляд исследовал математическую структуру науки, включая иерархию моделей от высокой теории до феноменологических моделей и природу подтверждения и валидации (т.е. правильную семантику) теоретических моделей.

Прагматический взгляд: Функции и допущения в научной теории

Перспективы синтаксических структур и семантических отношений, предлагаемые СИНТАКСИЧЕСКИМИ И СЕМАНТИЧЕСКИМИ ВЕЩАМИ, недостаточны для описания научного моделирования, поскольку:

  1. Практика, инструменты и эксперименты переплетаются с математическим моделированием.
  2. Существует множество синтаксисов моделирования — математика, диаграммы, повествования, моделирование, программы и т.д.
  3. Модели имеют неявные функции и допущения.

ПРАГМАТИКА ПРОВЕДЕНИЯ сосредоточена на контекстуальных факторах, агентах и их использовании. Например, писал философ Лео Апостол:

"Тогда R(S,P,M,T) укажут основные переменные модельных отношений. Субъект S принимает, с учетом цели P, объект M в качестве модели для прототипа T"

(Апостол, 1960)

Прагматический взгляд включает в себя синтаксис и семантику, а также исследует допущения и функции моделей.

Четыре функции математического моделирования

Прагматический взгляд помогает нам сосредоточиться на функциях математических моделей, включая

  • унификацию как моделей, так и данных
  • подгонку модели под данные
  • учет идентификации механизма наблюдения
  • прогнозирование будущих наблюдений

Унификация

Унификация включает в себя интеграцию и синтез разрозненных типов доказательств и моделей.

Например, Дарвин унифицировал гибридизационные, эволюционные, палеонтологические и биогеографические данные в рамках единой теории. В математическом моделировании унификация часто влечет за собой встраивание — подсумма-отношение, позволяющее унифицировать (i) различные математические теории/модели и (ii) данные, относящиеся к этим теориям/моделям.

Продолжение...

Наука
7 млн интересуются