Найти в Дзене

Первый скрипт на Python. Версия 1.

Рубрика "Новости первого скрипта".

1. Он уже считывает Cys-паттерны для пептидных токсинов пауков не из самого кода в .py-файле (это было слишком громоздко), а из отдельного .csv-файла, в который соответственно можно вносить какие душе угодно изменения. Правда конечно regExp'ы очень громоздкие и смотреть на них долго — это боль для глаз. Но по крайней мере это всё теперь не лежит рядом с самим кодом скрипта.

2. Добавил проверку наличия мотивов, характерных для токсинов скорпионов, таких как:
- мотив: цистеин-стабилизированные α-спираль и β-слой (CSα/β);
- мотив: две параллельные α-спирали, соединенные двумя дисульфидными связями (CSα/α 2(C-C));
Подумал, что поскольку и те, и другие членистоногие, могут быть случайные "гости" от скорпионов среди токсинов пауков.

3. Скрипт всё ещё выводит данные через print, а не сразу в .csv. Нужно допилить это + получше формализовать некоторые вещи для двух мотивов, и будет почти хорошо. Можно будет одним нажатием Shift + Alt + F10 делать на 3 секунды то, что я в Excel по своей дурости делал "вручную" по неделе раньше (моя дурость конечно не знает пределов порой).

Результаты нужны и для диссертации, и для статьи... Если из последней меня ещё не выкинули за безбожные срывы сроков. И если это вообще всё ещё будет актуально в свете начавшегося конца света.

Милый паук-скакунчик исключительно для привлечения внимания.

P.S. Выкладываю код на Pastebin. Не бейте особенно сильно, — я не настоящий сварщик, только начинаю.