Понимание и количественная оценка взаимосвязи между структурой и активностью может существенно повлиять на оптимизацию лидов и разработку лекарств, сводя к минимуму утомительные и дорогостоящие эксперименты.
Создавайте, проверяйте и применяйте свои собственные модели, основанные на широком спектре подходов, и продолжайте улучшать их по мере появления новых данных в программном обеспечении BIOVIA Discovery Studio
Оцените потенциальный риск, связанный с неблагоприятными фармакокинетическими свойствами и потенциальной токсичностью, с помощью распределенных моделей BIOVIA, расширьте их, чтобы лучше охватить ваше собственное химическое пространство, и используйте понятные признаки для обхода таких проблем.
QSAR
- Комплексная и последовательная подготовка данных:Лиганды: удаление дубликатов и обработка таутомеров и ионизации
Подготовить свойство ответа (масштабирование и биннинг)
Разделите данные на наборы для обучения и тестирования с помощью соответствующих методов. - Выбирайте из большого количества физико-химических, топологических, электронных, геометрических. дескрипторы на основе отпечатков пальцев и квантовой механики
- Создавайте статистические модели, включая байесовские модели, MLR (множественная линейная регрессия), PLS (частичные наименьшие квадраты) и GFA (генетический функциональный анализ).
- Анализировать и проверять модели с использованием областей применимости моделей (MAD), автоматической проверки набора тестов, перекрестной проверки и статистических показателей
- Выявление преобразований согласованных молекулярных пар (MMP) и провалов исследовательской активности
ADMET
Получите раннюю оценку своих соединений, рассчитав прогнозируемые свойства ADMET (абсорбция, распределение, метаболизм, экскреция и токсичность) для коллекций молекул, таких как кандидаты для синтеза, библиотеки поставщиков и коллекции для скрининга. Используйте результаты, чтобы исключить соединения с неблагоприятными характеристиками ADMET и оценить предлагаемые структурные усовершенствования, предназначенные для улучшения этих свойств перед синтезом.
Дескрипторы ADMET включают:
- Всасывание в кишечнике человека
- Растворимость в воде
- Проникновение через гематоэнцефалический барьер
- Связывание с белками плазмы
- Связывание CYP2D6
- Гепатотоксичность
- Фильтровать наборы небольших молекул для нежелательных функциональных групп на основе опубликованных правил SMARTS
TOPKAT
Оцените эффективность ваших соединений в экспериментальных анализах и на моделях на животных. Вычисляйте и проверяйте оценки токсического воздействия химических веществ и воздействия на окружающую среду исключительно на основе их молекулярной структуры. TOPKAT® (Прогнозирование токсичности с помощью компьютерных технологий) использует надежные и перекрестно проверенные модели количественной зависимости структурной токсичности (QSTR) для оценки различных конечных точек и использования запатентованного метода проверки оптимального прогностического пространства для помощи в интерпретации результатов.
Обратите внимание:
подробные сведения о наших расширяемых моделях TopKat были опубликованы в формате отчета модели QSAR (QMRF) в «Базе данных моделей QSAR» Объединенного исследовательского центра Европейской комиссии (JRC).
- Мутагенность Эймса
- Канцерогенность для грызунов (данные NTP и FDA)
- Доказательства канцерогенности
- Канцерогенное действие TD50
- Потенциал токсичности для развития
- Крыса орально LD50
- Максимально переносимая доза крысы
- Ингаляционная токсичность для крыс LC50
- Крыса хроническая LOAEL
- Раздражение и сенсибилизация кожи
- Раздражение глаз
- Аэробная биоразлагаемость
- Толстоголовый гольян LC50
- Дафния магна EC50