Найти тему
Почемучка рулит

Самая крутая визуализация на атомарном масштабе. Для тех, кто еще не видел

Вирус Зика. ИЛЛЮСТРАЦИЯ КОРОЛЕВСКОЙ ШВЕДСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК. Фото - https://www.nationalgeographic.com/magazine/2018/03/explore-wellness-nobel-prize-cryo-electron-microscopy/
Вирус Зика. ИЛЛЮСТРАЦИЯ КОРОЛЕВСКОЙ ШВЕДСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК. Фото - https://www.nationalgeographic.com/magazine/2018/03/explore-wellness-nobel-prize-cryo-electron-microscopy/

Криоэлектронная микроскопия была когда-то осмеяна и не признана ввиду ее низкого качества разрешения. Но прогресс неумолим и в последние годы крио-ЭМ-изображения превратились из "мутных пятен" в целостные модели, которые отображают отдельные атомы, как на рисунке выше.

Эта технология, созданная когда-то, позволяет увидеть в атомном масштабе.

Эта крутая техника визуализации принесла трем ученым Нобелевскую премию.

Благодаря этому достижению ученые теперь могут увидеть, например, вирусы, молекулы, структуры живой клетки, даже взаимодействие лекарство = живая клетка, что улучшает многократно изучение клеточных механизмов жизни. И уже сейчас, после внедрения этой удивительной и рабочей (то есть, ее теперь можно повторить в лабораториях по всему миру) методики, с 2013 года, можно найти в свободном доступе множество изображений микроструктур.

Правая сторона этой фиолетовой фигуры показывает, как когда-то выглядело изображение крио-ЭМ. Теперь вы можете увидеть разницу на левой стороне, прогресс в технике визуализации делает видимым почти каждый атом. ИЛЛЮСТРАЦИЯ МАРТИНА ХЁГБОМА, КОРОЛЕВСКАЯ ШВЕДСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК  источник - https://www.nationalgeographic.com/magazine/2018/03/explore-wellness-nobel-prize-cryo-electron-microscopy/
Правая сторона этой фиолетовой фигуры показывает, как когда-то выглядело изображение крио-ЭМ. Теперь вы можете увидеть разницу на левой стороне, прогресс в технике визуализации делает видимым почти каждый атом. ИЛЛЮСТРАЦИЯ МАРТИНА ХЁГБОМА, КОРОЛЕВСКАЯ ШВЕДСКАЯ АКАДЕМИЯ НАУК источник - https://www.nationalgeographic.com/magazine/2018/03/explore-wellness-nobel-prize-cryo-electron-microscopy/

Структура человеческого HCN4-активированного гиперполяризацией циклического нуклеотид-управляемого ионного канала. Рисунок - http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-0093/volume
Структура человеческого HCN4-активированного гиперполяризацией циклического нуклеотид-управляемого ионного канала. Рисунок - http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-0093/volume

Белковый комплекс - канал ядра клетки. Фото - https://www.youtube.com/watch?v=026rzTXb1zw
Белковый комплекс - канал ядра клетки. Фото - https://www.youtube.com/watch?v=026rzTXb1zw
Белок, фиксирующий колебания звуковых волн в человеческом ухе. Фото - https://www.youtube.com/watch?v=026rzTXb1zw
Белок, фиксирующий колебания звуковых волн в человеческом ухе. Фото - https://www.youtube.com/watch?v=026rzTXb1zw

Так выглядит биомолекулярная лаборатория. Наука не стоит на месте, можно ждать новых открытий. Фото - https://www.chemistryworld.com/news/explainer-what-is-cryo-electron-microscopy/3008091.article
Так выглядит биомолекулярная лаборатория. Наука не стоит на месте, можно ждать новых открытий. Фото - https://www.chemistryworld.com/news/explainer-what-is-cryo-electron-microscopy/3008091.article

Чтобы разглядеть структуры клетки ученым необходим инструмент для получения снимков высокого разрешения. Такими методами стали рентгеновская кристаллография и ЯМР-спектроскопия.

Но эти методики имеют целый ряд ограничений, например, не каждый изучаемый образец ткани можно перевести в кристаллический вид и поместить еще в вакуум (чтобы пропустить через него пучок электронов и потом на ПЗС матрице увидеть искомое изображение).

Но есть еще один, пожалуй, главный недостаток электронной визуализации. Это разрушение структуры изучаемых молекул пролетающими через образец электронами. Смотрите рисунок ниже.

-7

Ученые, Нобелевские лауреаты по химии за 2017 год, каждый по отдельности внесли свой вклад для получения визуализации высокого разрешения на атомном уровне.

Попробуем объяснить простыми словами. Почему стало возможным четко видеть мельчайшие структуры? Вся соль в особенностях подготовки образца изучаемого материала (например, живые клетки). Итак, изучаемый образец помещается в водяной капле на углеродистую пленку, затем на сеточку, затем быстро охлаждается в жидком пропане или этане, при температуре около -190º. Это позволяет воде замерзнуть без образования кристаллов. Потом производится серия криоэлектронных снимков, желательно под разными углами.

Метод Жака Дюбоше. Источник - https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/advanced-chemistryprize2017.pdf
Метод Жака Дюбоше. Источник - https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/advanced-chemistryprize2017.pdf

Получается это еще не все. Теперь, чтобы получить трехмерное качественное и правдивое изображение, другой ученый придумал специальную компьютерную программу для перевода 2-D в 3-D изображения.

Компьютер рассчитывает, как разные 2D изображения связаны друг с другом и генерирует высокое разрешение структуры в 3D. Источник - https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/fig_ke_en_17_franksimageanalysis.pdf
Компьютер рассчитывает, как разные 2D изображения связаны друг с другом и генерирует высокое разрешение структуры в 3D. Источник - https://www.nobelprize.org/uploads/2018/06/fig_ke_en_17_franksimageanalysis.pdf

Теперь уже понятно, что это революция в науке изучения клетки, как основы жизни.

Интересно, что основную работу Нобелевские лауреаты проделали еще в 1980 -1990 годах, но выйти на визуализацию на атомном масштабе получилось только в 2013 году. Пожалуй, не последнюю роль здесь сыграло развитие электроники и фототехники. Просто появилась такая фототехника, способная выдавать вот такие качественные изображения малых объектов. Конечно это еще не атомарный масштаб, но выглядят они круто.

Ниже вы можете посмотреть примеры электронной микроскопии. Эти снимки меня, как обывателя, впечатляют. Действительно, подобный прорыв в качестве визуализации объектов микромира приведет к новым открытиям.

Глаз бабочки. © Antonio Mucciolo Фото - https://wp.unil.ch/emf/examples-in-sem-2/
Глаз бабочки. © Antonio Mucciolo Фото - https://wp.unil.ch/emf/examples-in-sem-2/
Крыло стрекозы.© Antonio Mucciolo Фото - https://wp.unil.ch/emf/examples-in-sem-2/
Крыло стрекозы.© Antonio Mucciolo Фото - https://wp.unil.ch/emf/examples-in-sem-2/

Клетки мышиной печени. Исходный размер файла: 37'000 x 22'022 пикселей Фото - https://wp.unil.ch/emf/examples-in-sem-2/
Клетки мышиной печени. Исходный размер файла: 37'000 x 22'022 пикселей Фото - https://wp.unil.ch/emf/examples-in-sem-2/

Главная отрасль применения всего этого новаторства, как мне видится, это медицина и вот ниже примеры фото уже полученных структур. Фишка кроется в возможности визуализации взаимодействия лекарства и структуры-мишени, где, например, какой-нибудь новый препарат будет активировать ионный канал, или блокировать вирус, и этот живой процесс получается можно увидеть. Просто невообразимо круто!

Новые открытия уже не за горами.

КриоЭМ структура человеческого хлоридного канала ClC-1. Рисунок отсюда http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-4646/volume
КриоЭМ структура человеческого хлоридного канала ClC-1. Рисунок отсюда http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-4646/volume

Потрясающий комплекс Организмы: вирус иммунодефицита человека 1, Homo sapiens. Рисунок отсюда -http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-0485/volume
Потрясающий комплекс Организмы: вирус иммунодефицита человека 1, Homo sapiens. Рисунок отсюда -http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-0485/volume

Икосаэдрическая структура капсида вируса иммунодефицита человека 1. Разрешение 25,0 Å. Рисунок отсюда -
Икосаэдрическая структура капсида вируса иммунодефицита человека 1. Разрешение 25,0 Å. Рисунок отсюда -
Структурное распознавание ВИЧ-1 Т-клеткой , Homo sapiens. Рисунок отсюда http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-9109/volume
Структурное распознавание ВИЧ-1 Т-клеткой , Homo sapiens. Рисунок отсюда http://www.ebi.ac.uk/pdbe/entry/emdb/EMD-9109/volume

Будущее рядом...

По материалам -

1. https://www.nationalgeographic.com/magazine/2018/03/explore-wellness-nobel-prize-cryo-electron-microscopy/

2. https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2017/press-release/

3. https://wp.unil.ch/emf/examples-in-sem-2/

Наука
7 млн интересуются