Исследование биопсии ткани во многих случаях остаётся золотым стандартом при диагностике различных заболеваний. В случае диагностики онкологических заболеваний заключение по биопсии является критически важным для выбора лечения. И изучение слайдов биопсии остаётся сложнейшим искусством, требующим долгих лет тренировки и огромной ответственности. И даже при таком строгом подходе по одному и тому же слайду разные гистологи могут поставить разные диагнозы. Например, в случае некоторых видов рака молочной железы и рака простаты эксперты соглашаются друг с другом менее, чем в половине случаев. И это неудивительно: снимки гистологических препаратов, сделанных с 40-кратным увеличением, занимают десятки гигапикселей. Представьте себе, что вам нужно рассмотреть такой кадр, отвечая за каждый пиксел.
Пример работы программы на биопсии лимфоузла
Поэтому специалисты из исследовательского подразделения Google решили создать нейронную сеть для анализа биопсии в помощь диагносту. Об этом они рассказали в исследовательском блоге компании. Более подробно о том, как работает их свёрточная нейросеть, изложено в статье «Detecting Cancer Metastases on Gigapixel Pathology Images», которая выложена в открытом доступе.
В статье сообщается, что при поиске метастазов на гигапиксельном микроскопическом изображении (100 000х100 000 пикселей) их нейросеть определяет 92,4% опухолей размером до 100×100 пикселей всего при 8 ложноположительных определений на изображение, отличая опухоли от разрывов ткани и макрофагов. К слову, профессиональный диагност на тех же снимках выявил всего лишь 73,2% опухолей. При этом программа давала одинаково хороший результат как на «стандартной» гистологической коллекции Chameleon 16, так и на независимом наборе из 110 биопсий.
Текст: Алексей Паевский
«Detecting Cancer Metastases on Gigapixel Pathology Images» by Yun Liu, Krishna Gadepalli, Mohammad Norouzi, George E. Dahl, Timo Kohlberger, Aleksey Boyko, Subhashini Venugopalan, Aleksei Timofeev, Philip Q. Nelson, Greg S. Corrado, Jason D. Hipp, Lily Peng, and Martin C. Stumpe
Читайте материалы нашего сайта в Facebook, ВКонтакте и канале в Telegram
