В Чемпионате России 2006 года никаких изменений регламента не произошло. Первыми сезон для российских клубов открывали Локомотив и Зенит. И соперниками в 1/16 финала Кубка УЕФА были испанская Севилья и норвежский Русенборг. Матчи прошли 15-16 февраля первые и 23-го ответные. Зенит оба матча выиграл, а Локомотив – проиграл. 4 и 5 марта были сыграны первые матчи 1/8 финала Кубка России. Ответные этой же стадии – с 8 по 15 марта. 9 марта Зенит на выезде выиграл у Марселя матч 1/8 финала Кубка УЕФА...